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qPCR和WB结果不一致!?师兄告诉你怎么办! ...
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qPCR和WB结果不一致!?师兄告诉你怎么办!
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发表于 2024-5-22 14:54
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在科研中,我们常常期望在理想情况下从不同角度、用不同实验来论证同一件事。然而,实际情况是实验中的影响因素繁杂,导至有时得不到理想结果,不同实验的趋势也不一致,这确实让人颇为苦恼。
遇到这种情况不要慌,我们来仔细分析原因。
其一,这次的结果是否可靠?有没有进行重复实验?要知道,每次实验都是一次抽样,难免出现各种误差。像检测前样品没充分混匀、WB 曝光时曝光液没淋匀等,都可能造成趋势差异。重复实验虽折磨人,但不可或缺。
其二,从中心法则来看结果不一致的原因。基因转录出 mRNA,mRNA 再翻译为蛋白质,蛋白质执行生物功能。一般 mRNA 的水平和蛋白质的水平应是一致的,但若不一致,可尝试这样分析:
• 延迟效应:蛋白质合成需要时间,而 mRNA 的表达能更快响应刺激,从而导至变化时间差。
• mRNA 的可变剪接:转录后的 mRNA 可能有多种剪接体,而 qPCR 可能只针对其中一段,可能 mRNA 水平降低但其他剪接体增加,进而使蛋白水平升高。
• 负反馈:细胞内存在平衡,蛋白水平高可能抑制转录,导至 mRNA 因负反馈而下降,反之亦然。
• 蛋白翻译的调节:可能 mRNA 水平不变但翻译增强,导至蛋白量增加;或者有影响翻译的因素导至 mRNA 高而蛋白低。
• 蛋白翻译后的稳定性:蛋白翻译后的修饰如泛素化增加会使其通过蛋白酶体途径降解,导至蛋白水平下降。
总之,当不同实验结果不一致时,要牢记中心法则,思考最终起作用的是蛋白质,尝试分析原因,让我们的机制研究更严谨丰富。
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