分享 | 借“铁死亡”之鉴，行“铜死亡”之师

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分享 | 借“铁死亡”之鉴，行“铜死亡”之师所谓“年年岁岁花相似，岁岁年年题不同”。这个时节，我们要开始为一年一度的课题申报做准备。根据小编的调研线索，今年新出的“铜死亡”方向必是热门。所以，我们赶紧送上该篇葵花宝典，助力大家“逢申必得，逢投必中”。本篇中，我们会通过铜死亡的定义、研究进展以及铁死亡的课题汇总等几个方面做阐述，下面请听我娓娓道来。

什么是铜死亡
今年3月17日，哈佛-MIT博德研究所的研究人员在Science 上发表了一篇题为“Copper induces cell death by targeting lipoylated TCA cycle proteins” 的文章。文章中指出，研究者发现了一种新的、由铜引起的细胞死亡机制，这种机制不同于凋亡、铁死亡等任何一种已知的细胞死亡方式，并把它命名为Cuprotosis，即铜死亡。进一步研究发现，铜死亡是通过铜离子与三羧酸循环中的脂酰化成分结合发生的，导至脂酰化蛋白质聚集、铁硫簇蛋白下调，最终出现蛋白质毒性应激导至细胞死亡。该研究中还发现了10个与铜死亡有关的基因，分别是FDX1、LIAS、LIPT1、DLD、DLAT、PDHA1、PDHB、MTF1、GLS和CDKN2A。

铜死亡研究现状
在NCBI上以“Cuprotosis”为关键词进行检索，发现一共发表了143篇文献（由于是变化的，这个数值是当时小编检索得到的数值），其中国内发表的文章超过130篇，来自其它国家的不足10篇。影响因子主要集中在5-10分，内容方面主要是通过TCGA等数据库中疾病相关的数据进行生物信息学分析，部分研究增加了qPCR、WB等基础分子生物学实验的结果。为更好地进行深入了解，我们汇总了如下两个表格供参考。表格1是随机列举已发表的20+篇文献的题目、发表的杂志和影响因子信息；表格2是通过一句话对随机抽取的已发表的20+篇文献进行简单总结。

从这里我们可以看到目前铜死亡已发表的研究进展主要是依托生物信息学手段开展。这可以理解，毕竟从铜死亡概念的提出到现在仅有半年的时间，如果依托实验开展研究无法在短时间内发表文章。而且，通过生物信息学的手段我们可以筛选出一些与铜死亡相关的基因、通路，甚至可以预测与疾病的关系，也有利于后续以实验为基础的研究地开展。随着时间的推移，铜死亡的相关研究必定会回归到实验，甚至可能目前就有不少实验室已经在开展相关的实验。所以，我们可以参考一下铁死亡的相关课题，找一些值得借鉴的方向。

表1已发表的铜死亡相关文献信息举例

表2已发表的铜死亡相关文献总结举例

铁死亡课题概括
下面表格是以“铁死亡”为关键词统计的近5年来中标的课题数目，可以看出这5年来铁死亡相关的课题中标数目逐年递增，且大部分属于医学领域。

表3 从2018年到2022年铁死亡为关键词的中标课题数统计

我们再从每年中标的课题中随机抽取10个汇总成下表，可以看到以下几个共性：（1）绝大部分都涉及“机制研究”；（2）大部分都是研究与疾病的关系；（3）在2018年的课题中有多个课题涉及某一个基因或某种蛋白在铁死亡中的作用；（4）糖基化、代谢组学、羟甲基化、外泌体等均榜上有名。

表4 从2018年到2022年每年随机抽取10个课题汇总表

针对铜死亡，我们可以入手的点
一个新概念或者新方向提出来后，我们研究的目的无非是为了对它阐述清楚，再进一步来看是否对我们有利或让我们应用。正所谓知己知彼，百战不殆。铜死亡这一概念也不例外，基于其基础研究才刚起步，我们可以从阐明其概念、发生的原因、影响因素、发挥的作用以及应用这些角度逐步入手进行研究。这中间需要结合基础实验技术、生物信息学分析技术等各种手段的辅助，最终让铜死亡“为我所用”。


图5 铜死亡可以入手的方向举例

如果上面的内容看过后还觉得不过瘾的亲们，可以在我们公众号里搜索铜死亡三个字。我们以前还写过两篇关于铜死亡研究的思路文章，在那两篇文章中是结合具体的铁死亡文献案例进行阐述。这里我们也把两篇文章的题目附在下面供大家查阅：由“铁死亡”来推断“铜死亡”相关的组学研究思路（一）；由“铁死亡”来推断“铜死亡”相关的组学研究思路（二）。

写在最后
如果大家在组学方面有感兴趣的方向、技术或实验方法，但苦于没时间查文献或资料去了解的时候，也欢迎随时联系我们。我们筛选后会帮助查阅、汇总，并定期发布出来分享给大家。毕竟，为大家服务，我们是认真的！