IVD知识文库系列-方法学（11）微生物分类篇

纳兰烙烙

微生物分类篇

小桔灯网提供了知识文库的服务，今天小编分享的是第11部分，微生物相关检测。

小编有话说

微生物篇章是小桔灯网分享的第11个部分，区别于前边方法学标志性很强，微生物的篇章将会以检验科的微生物室作为基础，以IVD厂家中的“独角兽”梅里埃的产品线为顺序，开始逐步分享微生物篇章的知识。

谈起微生物，在检验技师/技士的证书考试里面，与临床检验技师不同的是，微生物检验技师是专门的一个分支。

之所以成为单独的分支，更是因为微生物学科是包含了现有所知的细菌、真菌、病毒、螺旋体、支原体、衣原体、立克次体、放线菌、寄生虫等多方面、跨学科、跨检测技术的学科。

微生物概述及起源

自然界中的生物极其纷繁复杂，根据其生物学特性的不同，可将其划分为动物、植物、真菌、真核原生生物、原核生物和病毒六大部分，除动物和植物外，其他4个部分的生物都属于微生物。

微生物的定义：个体微小，结构简单，肉眼直接看不 见，必须用光学或电子显微镜放大后才能观察到的微小生物的总称。

病原微生物的定义：自然界中绝大多数微生物对人类是无害或有益的，仅有少数是有害的，对人体有害并可引起人类疾病的微生物称为病原微生物。

医学寄生虫的定义：除上述病原微生物外，还有一些低等生物也能够引起人类疾病，如多细胞的蠕虫和节肢动物。蠕虫和节肢动物及前面提到的单细胞原虫，均可寄生于人体并引起人体疾病，称为医学寄生虫

菌种（species）的定义：是一个基本分类单位；是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近，与同属内其他种有明显差别的菌株的总称。

菌株（strain）的定义: 表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成的纯种群体及其一切后代（起源于共同祖先并保持祖先特性的一组纯种后代菌群）。因此，一种微生物的不同来源的纯培养物均可称为该菌种的一个菌株。菌株强调的是遗传型纯的谱系。

菌型(form)的定义：常指亚种以下的细分。当同种或同亚种内不同菌株之间的性状差异不足以分为新的亚种时，可以细分为不同的型。例如：按抗原特征的差异分为不同的血清型。

微生物的分类

微生物的分类

1.古细菌原界（Archaebacteria) ，

包括产甲烷细菌、极端嗜盐菌和嗜热嗜酸菌；

2.真细菌原界（Eubacteria) ，

包括蓝细菌和各种除古细菌以外的其它原核生物；

3.真核生物原界（Eucaryotes），

包括原生生物、真菌、动物和植物。

病原微生物的分类

根据病原微生物有无细胞，以及有细胞者细胞核的结构特点，可将病原微生物分为三大类。

1.非细胞型微生物

无典型的细胞结构，核心中只含有DNA/RNA一种核酸和蛋白质，只能在活细胞内增殖。例如：病毒。

2.原核细胞型微生物

仅有原始的核质，细胞器不完整细菌。例如支原体、立克次体、衣原体、螺旋体、放线菌。

3. 真核细胞型微生物

有核、核膜和核仁，细胞器完整。例如真菌。

微生物的分类方法

1970年Colwell提出了多相分类学的概念，是一种整合基因型、表型和种系发育的所有资料进行分类的方法学。

基因型以核酸序列为依据，表型则主要以蛋白质极其功能为依据。

1.基因型方法

1）DNA-DNA杂交法

可以反映细菌中间DNA序列的相似程度，即细菌DNA的同源性。

2）DNA的G+C百分比

即（G+C）mol%，是传统的基因分型特征参数，也是细菌分类单元的标准描写要求的一部分，具有否定菌种的价值。

3）DNA-rRNA杂交法

用Tm(e)和RNA结合数表示，Tm(e)值是DNA与rRNA杂交解链一半时所需要的温度。RNA的结合数是100mgDNA所结合的rRNA的mg数，可以反映菌群的关系远近。

4）rRNA同源性研究

rRNA存在于所有细胞型微生物中，它的功能恒定，组成高度保守，同时又有许多可变区域。可测5SrRNA序列、16SrRNA序列、23SrRNA序列，可作为细菌属、科及以上等级分类的依据，做菌种遗传特征描述。

5）进化同源基因分型

生物大分子血红蛋白、细胞色素C等由于功能保守，它的基因称为进化同源基因，常见的有热休克蛋白基因（伴侣蛋白）、RnpB、gyrB，作为菌种关系远近检测。

6）16S-23SrRNA区间（ISR）序列分析

可以进行细菌种属分类和鉴定。

7）rDNA限制性片段多态性分析

可进行电泳图的细菌种属相似性分析。

8）核糖分型技术

所用探针科技与16SrRNA、23SrRNA，用于种间或株间的区分。

9）DNA指纹分析法AFLP

采用PCR技术从限制性片段中选定的DNA片段进行扩增。

10）分子时钟

采用各种核糖体蛋白、ATP酶β亚单位、延伸因子Tu、伴侣素和RNA聚合酶。分子净化率相当于16SrRNA。

2.表型方法

传统的表型方法涉及到形态学、生理学和生物化学。

形态学：细胞的特征和微生物群体的特征。生理和生化特征包括：生长条件、酶、代谢产物、化学物质利用、抗菌药敏感或耐药。

1）数值分类法

借助计算机对大量菌株的大量表型资料进行分析计算，在此基础上绘制系统分类的树状图，进行受试菌分类或鉴定。

2）化学方法

（1）细菌细胞脂肪酸分析

（2）细菌全细胞蛋白质分析

（3）细菌化学分子标志

细菌的分类

细菌（bacterium）

具有细胞壁的单细胞原核细胞型微生物

球菌： 直径：1mm

杆菌： 长 ：2～3 mm

宽 ：0.3～0.5mm

螺形菌: 与杆菌相似

测量单位：μm ，1μm=1/1000mm

细菌的结构

小编将在本章节带来微生物篇章的立体全方位的内容分享，包括了微生物的分类、检测方法、涉及厂家、市场常见的检测产品等知识。

macro20

微生物学已经忘得差不多了

纳兰烙烙

macro20 发表于 2018-3-9
微生物学已经忘得差不多了

确实啊，哈哈