教你秒懂 “MSI”基因分型图谱

阅微

微卫星是一种短串联重复序列，由于微卫星的重复序列在DNA复制过程中固有不稳定性。在正常细胞中DNA错配修复系统可以快速修正这种错误，但是肿瘤组织中常见错配修复基因缺陷，引起重复单位插入或缺失导至微卫星长度改变，从而表现为MSI，即微卫星不稳定性(microsatellite instablility)， 已有研究表明，MSI与肿瘤的发生密切相关。

临床已将MSI作为结直肠癌（CRC）预后和制定辅助治疗方案的重要分子标志物，主要应用于Lynch综合征（错配修复基因胚系突变）的筛查、II期结直肠癌患者的用药指导和预后预测、转移性结直肠癌患者PD-1免疫治疗获益的预测。MSI状态可通过聚合酶链式反应（PCR）方法检测。通过检测6个单核苷酸位点（NR-27、NR-24、NR-21、BAT-25、BAT-26、MONO-27）以及 PentaC和PentaD 2个对照位点、1个Amel性别位点（用以识别潜在的样品混杂及污染）共检测9个位点来保证检测结果的准确性，属于国内领先技术。MSI分级标准见下表。

以阅微基因MSI检测结果为例，大阅哥为您介绍MSI-H、MSI-L、MSS图谱分析方法。

通常MSI的检测样品包含一对肿瘤组织和正常组织（通常是血液或癌旁组织），通过提取样本DNA→多重荧光PCR扩增→毛细管电泳检测→Genemapper软件分析等一系列流程后，将得到肿瘤组织和癌旁组织（对照组织）的MSI分型图谱，如示例图所示：

图1 MSI-H图谱（6个位点突变）

图1所示为MSI-H的检测结果，可以很清晰的发现，相比于正常组织，在肿瘤组织的NR-27、NR-24、NR-21、BAT-25、BAT-26、MONO-27六个单核苷酸位点均多出了一个五指峰，因此判定为高度微卫星不稳定（≥2个位点不稳定）状态，即MSI-H。

图2 MSI-L图谱（1个位点突变）

图2所示为MSI-L的检测结果，发现肿瘤组织中MONO-27的单核苷酸位点出现了两个五指峰，正常组织中该位点为单个五指峰，仅出现一个位点突变，判定为MSI-L。

图3 MSS图谱（没有位点突变）

图3所示为MSS的检测结果，肿瘤组织和正常组织中各检测位点峰型和数目一致，无位点发生突变，判定为MSS。