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[讨论] miRNA到底是怎么命名的?

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发表于 2016-3-20 13:38 | 显示全部楼层 |阅读模式

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虽然我们之前讲过MiRNA到底是怎么回事(不明白点这里),但是还是有人在后台来问了这样的问题:

640.webp (1).jpg

好吧,我们再给你仔细掰掰,MiRNA到底是怎么命名的。

MiRNA首先是由MiRNA的host gene转录获得的,host gene转录,形成了primary microRNA(pri-MiRNA),然后通过Drosha–Pasha 复合体,形成了precursor microRNA(也就是pre-MiRNA),接着pre-MiRNA被Dicer剪切成双链的RNA,然后双链RNA被AGO1保护起来,其中一条链被降解,另一条链就被保留下来了。

640.webp (2).jpg

被降解的链一般被称之为“Passenger strand”,这条链一般不容易被检测到,很简单,因为被降解了嘛。这条链也被称之为星号链,一般会表示为“miR-×××*”。另一条链被称之为“Guide strand ”,也就是先导链,这条就是我们通常所说的miRNA。

用这样的命名方法的话,比如我们说MiRNA-21和MiRNA-21*,就大概是这样的:

640.webp (3).jpg

这个图上,我们可以看到MiRNA-21是产生在precursor microRNA的5'臂上的,而MiRNA-21*是产生于precursor microRNA的3'臂上的。“*”这个标志,主要告诉我们,这条链是“Passenger strand”,也就是miRNA-21产生的一个副产品,表达量超低,所以星号链经常被认为是没有功能的。

但是,问题来了,2011年开始,有很多文献,开始表明miRNA星号链是有功能的(Widespread regulatory activity of vertebrate microRNA* species.,Yang,2011),星号链的功能,也有可能比先导链更为高级。那这样用“*”来标记就有点过时了。

640.webp (4).jpg

于是就产生了这样的命名方法,就是按照microRNA产生于precursor microRNA的5'臂或者是3'臂,来将miRNA表示成“MiR-×××-5p”或者“MiR-×××-3p”,这样的话miR-21,就被命名成为了“miR-21-5p”,它的星号链就被命名成为了“miR-21-3p”。

当然,之前还有用“-s”(sence)“-as”(antisence)来对先导链(先导链是-s)和星号链(星号链是-as)来命名,主要是dsRNA形成过程时的正向和反向。但由于很容易搞混,所以已经被取消了。可能看到老一点的文献中会有,别搞迷糊了。

…华丽丽的分割线…

李莫愁博士:有可能大家觉得MiRNA已经是老生常谈了,但是,其实还是有很多细节,我们可以深究一下的。比如这样简单的命名而言,我们会看到有先导链和星号链两种,而星号链的研究,其实也是比较热门的。表达量这么低的miRNA是不是会有什么作用呢?是不是很关键呢?有机会再给你们讲星号链相关的文献吧,好了,今天就策到这里吧。

来源:实验万事屋

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