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[分享] 解决微生物测序难题最省钱方案来袭

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发表于 2016-3-18 14:54 | 显示全部楼层 |阅读模式

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天津生物芯片通过基于第三代测序技术PacBio RS II的全基因组测序,可以快速低成本地组装出细菌的完成图,预测重要基因和蛋白以及了解其功能和机制。完成图在研究病原菌的致病性与疾病的预防和治疗方面,鉴定致病相关基因、开发和研究药物,疫苗、开发新型抗生素等方面具有非常重要的应用。同时它在研究细菌进化,生理和生态多样性,种内进化关系也有其他技术所不具备的优势。细菌de novo测序已取代传统方法成为研究细菌遗传机制,锁定关键功能基因的重要工具。

测序策略

测序策略
参考指标
交付周期
PacBio RS II
平台
10kb SMRT bell
文库
>=100X测序深度
完成图
单碱基错误率<0.01%
建库测序:1个月
标准分析:1个月
高级分析:根据实际信息分析内容而定

生物信息分析

基础分析
高级分析
原始数据处理

COG功能分类

基因组拼接

GO功能分类

基因功能注释

KEGG代谢通路

基因预测

跨膜结构与信号肽预测

rRNA、tRNA查找

基因组圈图


价格

新年伊始,天津芯片公司用三代测序助力细菌基因组完成图,为各位科研老师节省时间节省经费。




二代测序
三代测序
时间
4
2
完整性
2-3 gap
0 gap
价格
2-4
惊爆价(来电来函咨询)
T:022-6629538
机会难得,时间有限

参考文献

Koren, Sergey, et al. "Reducing assembly complexity of microbial genomes with single-molecule sequencing." arXiv preprint arXiv:1304.3752 (2013).

Bashir, Ali, et al. "A hybrid approach for the automated finishing of bacterial genomes." Nature biotechnology (2012).

Rasko, David A., et al. "Origins of the E. coli strain causing an outbreak of hemolytic–uremic syndrome in Germany." New England Journal of Medicine 365.8 (2011): 709-717.

Murray, Iain A., et al. "The methylomes of six bacteria." Nucleic acids research 40.22 (2012): 11450-11462.
Clark, Tyson A., et al. "Characterization of DNA methyltransferase specificities using single-molecule, real-time DNA sequencing." Nucleic Acids Research 40.4 (2012): e29-e29.
[本次活动最终解释权归天津生物芯片所有


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天津生物芯片技术有限责任公司
服务热线:022-66229538
网址:www.tjbiochip.com
E-mailtjbiochipmk@126.com
地址:天津经济技术开发区海云街80号融通大厦B2-3
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