新技术ViroCap几乎能检测出所有人畜病毒

检验之星

　　目前已知导至人畜患病的病毒多达成千上万种，而准确地诊断出它们又是是一个漫长且昂贵的过程，涉及到无数次的检测。

　　发生在人体身上及身外的病毒统称为病毒组(virome)。通过该研究的主要作者Gregory Storch博士及儿科学教授Ruth L. Siteman，在一个已知的程序“增强病毒组学测序”，研究人员已经开发出一种方案并能“有效的检测目前已知的非常低水平的病毒。”相关研究报告发表在2015年9月22日的《基因组研究》上。

　　目前已知没有足够灵敏的检测方法能检测出低水平病毒粒子，或者只能检测出被怀疑是致病原因的病毒。

　　新检测方法可以用于检测出爆发性致死性病毒如Ebola、Marburg和SARS，以及更多常见的致病病毒，包含轮状病毒和诺如病毒，这两种病毒均可导至严重胃肠道感染。

　　研究团队希望该项检测技术在传统检测技术无法检测出致病病毒或不明原因导至疾病暴发的情况下使用。

新检测技术揭示标准检测技术无法检测出的病毒

　　新检测技术被称为ViroCap，已经在患者的标本中检测出标准检测技术无法检测出的病毒。

　　该技术在检测序列和病毒检测上跟PCR方法具有相似的敏感性，而PCR方法在临床实验室被大规模使用并且被认为是病毒检测的“金标准”。

　　然而，虽然PCR检测可在同一时间筛选出多达20个类似的病毒，可理论上ViroCap似乎可以检测几乎任何病毒。

　　为了发展该技术，研究人员收集了已知感染人和动物的所有病毒组的独特结构DNA或RNA：总共200万的特异性遗传物质。

　　这些遗传性物质被当做探针去挖掘出在患者标本中的病毒，根据遗传物质匹配。匹配后的病毒遗传物质之后被使用高通量基因测序进行分析。

　　研究团队表示，随着完全新型病毒的发现，它们的遗传物质可以很容易的添加到这个检测中。

评估显示ViroCap比常规检测有效性超52%

　　研究人员通过对来自圣路易斯儿童医院患者的两组生物样本（例如血液、大便和鼻腔分泌物）来评估这项新的检测技术。

　　标准检测只在14名患者中的10名中检测到病毒，还未能检测出常见病毒如副肠孤病毒、乙型流感病毒和疱疹病毒。而新的测试则在4名病例中发现了较早的基因组测序所错过的病毒。

　　在另一组8例不明原因发热的儿童中，标准检测检测到11种病毒，但ViroCap发现了另外七种，包括一种通常无害但是可以导至一些人严重感染的呼吸道病毒。

　　总之，这两组患者中检测到的病毒数量从21种增加到32种，或者说增加了52%。

　　新的检测技术也使病毒亚型容易识别，因为它包含了有关特定病毒的各种菌株详细的遗传信息。

　　例如，在标准检测鉴定病毒为A型流感病毒时——这种病毒会导至季节性流感，新的检测技术表明，该病毒是一个特别的亚型被称为H3N。

　　上一个流感季节，H3N2导至了美国各地的36000人死亡。这些信息可能会促进更有效的治疗患者，如幼儿、老年人和免疫系统虚弱的人。

　　研究人员Todd Wylie说道：由于该技术过于敏感以至于它可以检测各种跟常规病毒非常相近的病毒变异株。其中轻微的病毒遗传变异往往不能被现有的检测来区分，而只能依靠检验医师通过一种检测手段去检测所有各种变异。

　　这种称为ViroCap的测试的准确性仍需进行临床试验，因此可能还需要几年时间才能用于患者，但该技术在研发途中已经提供给医疗服务提供者和研究者们。

　　作者希望将这项技术继续进行改进，以便能检测出不仅包括病毒在内的病原体，还包括细菌、真菌和其他微生物。同时它还可以显示病原微生物对哪种抗生素耐药从而避免使用，据研究的合作者Kristine Wylie说到。

　　新的检测将能更好地了解这种病毒以及其在保持身体健康中所扮演的角色。

　　今年早些时候，Medical News Today报道了一种名为VirScan的检测，研究人员说其可以通过扫描患者的一滴血便可检测出患者的整个病毒感染史。


来源：艾兰博曼网