ABC for cfDNA：临床应用篇

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Q1：ctDNA能够检测到那些遗传变异情况？

ctDNA中能够检测到的遗传变异信息非常丰富，从简单的点突变和indel到复杂的结构变异（structural variation），甚至染色体拷贝数变异都能够检测到。在表观遗传层面，ctDNA中可以检测到基因启动子区的甲基化。在细胞器遗传物质层面，ctDNA中可检测线粒体DNA（mtDNA）的变异情况。

Q2：是否所有的肿瘤都会产生ctDNA，且能够在外周血中被检测到？

因为ctDNA主要是死亡的肿瘤细胞破裂后所释放出来的、片段化的基因组DNA。理论上，所有的肿瘤都会产生ctDNA。但是，ctDNA的检出率是高度依赖于肿瘤发展阶段、肿瘤类型和检测手段这三个重要因素。

肿瘤发展阶段上，ctDNA含量通常在晚期或转移性肿瘤中较高，而在早期或局限性肿瘤中含量较低。肿瘤类型上，有研究表明ctDNA在原发性脑肿瘤（如胶质瘤），肾癌，前列腺癌和甲状腺癌中含量较低（晚期肿瘤中检出率<50%)。检测手段上，数字PCR和BEAMing系统的灵敏度是最高的，在肿瘤早期也有较高的检出率，而同期高通量检测手段（多基因靶向测序或外显子测序）检出率较低。

Q3：为什么原发性脑肿瘤（如胶质瘤）外周血中的ctDNA含量最低？

目前认为，主要是因为血脑屏障的阻碍，使得原发性脑肿瘤的ctDNA较难进入到外周血中。作为一种替代方式，有研究表明对于原发性脑肿瘤，可通过脑脊液来检测ctDNA的特征。

Q4：外周血中的cfDNA的含量，能否作为诊断肿瘤发生的标志物？

尽管有研究证实肿瘤患者外周血中的cfDNA总量，要高于健康人。但是大量的研究已经证实，在不考虑cfDNA上基因突变特征前提下，仅仅依靠cfDNA的含量，是不足以作为诊断肿瘤发生的标志物。

Q5：外周血中的ctDNA，能否作为肿瘤诊断的标志物？

目前有研究支持ctDNA在作为肿瘤诊断标志物上具有巨大的潜力，但是还存在许多问题，尚无一个较公认的应用实例。

在ctDNA在用于诊断方向时，多选取该种肿瘤的频发突变基因作为标志物。但由于属于某一中肿瘤特征性的突变热点或突变基因较有限——尤其是对于实体瘤。因此，ctDNA诊断应用，一方面要密切结合其他传统肿瘤早筛和诊断的方法，另一方面在看到其高特异性的同时，应清楚地认识到其灵敏度有限。

Q6：外周血中的ctDNA，能否作为肿瘤预后的标志物？

外周血中的ctDNA，无论是量，还是特定的基因突变类型（例如KRAS等）都可以作为肿瘤预后的标志物。研究的趋势倾向于，使用肿瘤特异性突变特征（包括突变类型和拷贝数）的变化，作为肿瘤预后的标志物。

Q7：外周血中的ctDNA，能否用来预测治疗效果？

外周血中的ctDNA能够用来预测药物治疗的效果，这也是ctDNA作为肿瘤监测应用非常重要的一个方面。它的预测效能主要通过两个方面来体现，一个是肿瘤特异性突变拷贝数的变化，这种变化反映了肿瘤负荷对药物治疗的响应程度；另一个是肿瘤突变类型（主要是指耐药突变）的演化，这种变化反映了肿瘤内部耐药克隆筛选的进程，这将直接导至药物失效。

Q8：无创性ctDNA检测，检材是否只局限于外周血？

作为一种无创检测，ctDNA检测最常用的检材是外周血。但也有很多研究证实尿液和唾液也能够检测到ctDNA。

Q9：基于cfDNA的液态活检（对于肿瘤来说即是ctDNA），是否只应用于肿瘤？   

尽管ctDNA在肿瘤诊疗中的应用是当下cfDNA最广泛，研究最深入的分支。但是，cfDNA作为液态活检，不只是局限于肿瘤学。例如，有研究报道对于接受器官移植手术的病人，可以通过监测术后外周血中具有捐献者基因特征，片段化的cfDNA含量变化，来评估移植器官的排斥情况。

来源：液态活检