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[分享] 干货分享!只需5步,教你跑出漂亮的大分子WB图

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发表于 2024-11-29 09:36 | 显示全部楼层 |阅读模式

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若你正致力于研究高分子量蛋白(超过150KD),却困扰于难以获得理想的Western blot结果,那么本文一定是你想要的答案!
01凝胶选择是关键
三大最常见的凝胶类型:Tris-Glycine、Bis-Tris与Tris-Acetate。Tris-Glycine凝胶,pH值8.6,保质期短暂,运行中pH易升至9.5,引发蛋白降解与分辨率下降。Bis-Tris凝胶,pH值6.4,相较于Tris-Glycine,稳定性与保质期有所提升,但需添加抗氧化剂(如DTT)保持蛋白还原状态。Tris-Acetate凝胶,pH值7,针对大分子蛋白展现卓越分辨率。因此,针对大分子蛋白,我们推荐使用Tris-Acetate凝胶。02凝胶浓度同样关键,可使用梯度凝胶
选定Tris-Acetate凝胶后,还需注意以下几点。需知,凝胶浓度与孔径负相关:浓度越低,孔径越大。大分子蛋白更易通过大孔径,故推荐使用低浓度凝胶,如7%。梯度凝胶可作为优选,尤其适合新样本探索。尽管自制梯度凝胶操作复杂,需专用装置,但市面上已有多种预制梯度凝胶,覆盖不同范围,极大简化了实验流程。
03优化转移Buffer:增SDS,减甲醇
转移Buffer的配方对实验至关重要。甲醇易导至大分子蛋白沉淀,因此应降低其在转移Buffer中的比例至10%或更低,以预防此现象。同时,为进一步保障蛋白不沉淀,建议将SDS添加至终浓度0.1%。SDS能为蛋白均匀附加负电荷,促进其从凝胶向膜的有效转移。04膜材选择需谨慎
膜材通常包括PVDF膜与NC膜,针对大分子蛋白,PVDF膜更为适宜。
如前所述,甲醇易使大分子蛋白沉淀,而PVDF膜的使用无需在转移Buffer中添加甲醇,从而提高了目标蛋白的转印效率。
PVDF膜孔径多样,以0.2μm和0.45μm最为常见。与凝胶原理相似,大蛋白相较于小蛋白更易穿透大孔径。对于多数蛋白质(>20kDa),推荐使用0.45μm膜进行转移,尽量避免使用0.2μm孔径的膜。05延长转印时长
选定合适的凝胶、转印膜及转移buffer后,转印步骤随即启动。尽管半干转以其速度与便捷性著称,却非大分子蛋白的理想选择。鉴于此,试剂君倾向于推荐湿转法,特别是针对大分子蛋白,其转移过程较为缓慢,建议采用350-400 mA电流转印90分钟,或在4°C条件下以40 mA电流转印过夜。
有实践者证实,对于接近200 KDa的蛋白(例如EGFR),半干转同样能取得良好效果。更有观点指出,即便是接近300 KDa的庞大蛋白如mTOR,通过优化半干转条件(例如,遵循仪器预设程序进行一次转印,中间暂停以冷却,再继续转印),亦能成功获取结果。
因此,湿转与半干转的选择可依据个人经验而定,但关键在于必须适当延长转印时间。
小贴士
针对PVDF膜封闭,BSA并非最佳选择,因其效果欠佳。因此,试剂君推荐使用0.5%酪蛋白(Casein)作为封闭液。
具体操作步骤如下:将酪蛋白融入缓冲液中,置于加热板上加热至80℃或直至完全溶解,不要将溶液煮沸。使用前需冷却至25-40℃。
在整个检测过程中,务必保持膜面湿润。如果膜部分变干,可让膜完全干掉后,以甲醇重新润湿,再浸入缓冲液中,后续操作。
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