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[分享] WB 实验结果的分析方法有哪些?

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发表于 2024-11-1 12:05 | 显示全部楼层 |阅读模式
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发表于 2024-11-1 12:06 | 显示全部楼层
WB(Western Blot), 即蛋白印迹或免疫印迹(immunoblotting),是一项在分子生物学、生物化学、免疫学等领域中应用非常广泛的技术。这一技术利用抗体与组织或细胞样品中特定蛋白的特异性结合作用,根据显色条带的位置和强弱实现蛋白鉴定表达分析。WB技术具有SDS-PAGE的高分辨力和固相免疫测定的搞特异性和敏感性。选用合适的内参抗体能够校正蛋白定量和上样过程中的误差,通过灰度计量可以定性或定量分析不同样品中蛋白表达情况。载基提供WB检测技术服务,提供编码基因表达水平的确凿证据,用于特定基因调节,基因功能研究,也可以作为蛋白芯片、蛋白质谱的验证实验。
WB条带灰度值分析怎么做???
具体步骤如下:
1、将内参蛋白图片文件拖入Photoshop中进行调整和截图,得到平整的条带图


2、进行同样操作,将目的蛋白条带截出(三个重复,本次以其中一个作为演示)


3、将截好的条带拖入Image J软件中,点击矩形工具,进行框选,最好逐一条带进行框选,减少误差


4、点击Ctrl+1,2,3,得到波峰(如果有开口,用直线工具将开口的波峰关闭,形成密闭空间)


5、使用魔棒工具,点击波峰可以显示波峰下的面积,即条带的灰度值


6、将所有灰度值汇总到Excel表格中


7、将目的蛋白的灰度值除以内参蛋白的灰度值


8、以组间对照组为1,其余组除以对照组的平均值,再次进行归一处理


9、求平均值


10、求SD值(标准差值),第一次归一处理的SD值与第二次归一处理的SD值相等。第一次的需除以对照组的平均值。(对照组的SD值需以第一次归一的数值进行处理)


11、以第一次进行归一的值求显著性差异(P-value)


12、得各组平均值、标准差、显著性,进行作图


13、在GraphPad Prism软件中输入对应数据


14、得最终柱状图,纵坐标为蛋白相对比率,横坐标为组别

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发表于 2024-11-1 12:07 | 显示全部楼层
1、在百度上搜索Image J软件然后下载到电脑上安装完毕。安装好Image J软件后,将你做的WB的片子进行扫描,得到扫描版图片。

2、完成步骤1后,装好Image J软件后,点击软件上方的File,下拉点击Open,将扫描图片拉入进入软件中。接着点击软件上方的Image,下拉第一个是Type,点击,将其改为8-bit。

3、点击analyze,下拉点击set measurement,点击图中所勾的四个选项。然后点击ok确定。然后点击process,下拉点击substract background,只勾图中light background一个选项,点击ok即可。

4、完成第三步后,点击analyze,下拉出现set scale,点击它,弹出一个小框,把unit of length 那个空白框内的英语改为pixels,点击OK即可。

5、完成前四步后开始点击file下方一些列不规则圆圈,选择心型圆圈,点击出现freehand selections。然后点击Edit,下拉出现invert,点击即可。

6、最后一步,进行灰度统计。用鼠标选择图中亮色区域,尽可能的把亮色区域全部圈起来。然后点击anlyze下拉出现的measurement,即可弹出你选定区域的灰度统计值。
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