举一个例子。
实验目的:初探mutant p53是不是通过蛋白酶体的泛素化降解的。
实验设计:选一个阳性对照细胞,A549 有wt p53;选一个实验细胞 H1975 有mutant p53 R273H 突变;选一个抑制剂MG132, 10uM。定MG132的作用时间点 0,1,2,3,4,5,6小时 (大部分细胞在MG132 10uM 6小时以后都开始要挂了)。
Day 0. seed A549 cells in 6-well-plate, seed H1975 cells in 6cm dishes (because H1975 is bigger than A549).make sure cells will reach about 60-70% confluence next day.
Day 1.
8AM ----- make MG132 10uM in cell culture medium, mix well, and let it consolidate for about 1h, meanwhile, change all of the wells with fresh complete medium.
9AM ----- 吸走一个well/dish的培养液,加 MG132 10uM的培养液,此为6小时之样品;
10AM,11Am,12PM,1PM,2PM 如法炮制。准备好1%SDS lysis buffer, 用之前加上benzonase,混匀,室温。
3PM开始收样本。倒掉所有培养液(快点),温PBS洗三次(要快点)。尽量吸走所有PBS,6孔板的每孔加100ul之lysis buffer,6cm dish 加120-150ul之lysis buffer。都在室温下操作,刮下来,刚开始刮,会粘粘的,那是DNA跑出来了,一会就稀了。室温下收100ul (A549)120ul (H1975), BCA法蛋白浓度,算蛋白浓度,算2.5ug, 5ug, 10ug, 20ug 总蛋白之体积,大约需要40-50分钟。期间,样本中加laemmlli buffer, 可以煮,也可以不煮。-80C保存。一天的工作结束。
次日,跑胶。选15个孔的胶,两边加protein ladder。注意:关键是0点对照样本,即A549 0h, H1975 0h,尤为重要,跑胶还可可能会有边沿效应,会影响到第一个孔,和最后一个孔的条带,所以胶的第一个和最后一个孔,要斟酌。
要看p53,用Santa cruz的DO-1抗体,1:2000稀释。A549样本上10ug,H975 样本上2.5ug。
看GAPDH, 用santa cruz 的那个看抗体,1:10000稀释,上5ug.
试着看看NRF2,因为NRF2的量可能不高,各个样本都上10ug.
尽量使各个孔内上样的体积,都差不多,不够的,可用1X的leammlli buffer 补。
然后,----,然后,----,western 做完了,分析条带。
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