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Western Blot实验三个常见内参选择指南:GAPDH、Tubulin还是Actin?
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发表于 2024-9-18 21:36
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在Western Blot实验中,选择合适的内参蛋白对于确保实验结果的准确性至关重要。
今天小曼带小伙伴们探讨三种常用的内参蛋白——GAPDH、Tubulin和Actin,并指导您如何根据实验条件选择最合适的内参。GAPDHGAPDH是在细胞代谢糖酵解中起关键作用的酶,分子量36kDa,通常表达量较高,在同种细胞或组织中的表达量一般是恒定的,且很少受外部诱导物的影响。
然而,在某些特定条件下,比如缺氧和糖尿病等疾病存在时,其表达可能会发生变化,因此在这些情况下不推荐作为内参。
Actin Actin(最常用β-actin)是构成细胞骨架的主要蛋白之一,分子量42kDa,是一类形成微丝的球状多功能蛋白质。
它在许多真核细胞中都有广泛且稳定的表达。根据它们的等电点分为三类(α, β和γ),一般来说,α肌动蛋白存在于肌肉中(α-骨骼,α-主动脉平滑,α-心脏),而β和γ在非肌肉细胞中很突出(β-细胞质,γ1-细胞质,γ2-肠道平滑)。适用于全细胞和细胞质样品的标准化,但在上样量较大时要注意其线性范围。
Tubulin Tubulin是构成微管网络的重要蛋白,分子量约55 kDa,微管蛋白是球形分子,参与维持细胞形态和分裂过程。
它的表达水平也可能随细胞状态而变,因此使用时需要验证其稳定性。实验应用建议 在选择内参时,重要的是考虑您的实验条件和研究背景。不同的细胞类型和实验目的可能需要不同的内参。
在做多组织多细胞样本对比表达量时,最好选用GAPDH作为内参,因为GAPDH是代谢类蛋白,在活组织中表达比较恒定。而beta Actin和beta Tubulin是结构蛋白,不同组织的细胞结构会有差异性。建议事先进行文献查阅和预实验,以确定哪种内参在您的实验条件下最为稳定。
没有一个“一刀切”的最佳内参选项,最合适的内参应当基于实验的具体情况来确定。希望这篇指南能帮助您做出明智的选择,确保Western Blot实验结果的可靠性。
原文地址:https://zhuanlan.zhihu.com/p/694272533
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