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[分享] 病理诊断怎么做好?

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发表于 2024-9-18 18:44 | 显示全部楼层 |阅读模式
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发表于 2024-9-18 18:45 | 显示全部楼层
近日,浙江大学医学院第一附属医院科研团队在知名学术期刊Advanced Science (IF 17+)上发表题为《A Pathologically Friendly Strategy for Determining the Organ-specific Spatial Tumor Microenvironment Topology in Lung Adenocarcinoma Through the Integration of snRandom-seq and Imaging Mass Cytometry》的学术论文[1]。该研究利用VITA单细胞全长转录组平台对石蜡包埋(FFPE)样本进行单细胞转录组测序,首次揭示了肺腺癌(LUAD)的器官特异性肿瘤微环境(TME)单细胞图谱,为开发器官特异性的治疗方法提供了依据。


该研究中使用的snRandom-seq系一种适用于FFPE样本的新型、高灵敏度全长单核RNA测序方法,是M20 Seq技术在FFPE样本领域的重大应用突破。
实验设计方案

该研究使用14个来自肺腺癌(LUAD)患者的,配对的FFPE组织样本,其中包括7个原发性LUAD样本,和7个不同器官的转移灶样本(3个脑转移样本,2个肝脏转移样本和2个肾上腺转移样本),并使用VITApilote®高通量FFPE单细胞转录组产品对上述FFPE样本进行单细胞转录组测序,通过成像质谱(IMC)技术对空间TME进行分析,从而揭示LUAD的器官特异性TME,发现在免疫治疗反应不同的器官之间存在异质性,其中的免疫细胞分布及信号通路表达均存在差异(图1)。



图1.实验设计方案(上:单细胞测序分析;下:成像质谱分析)

主要研究结果
01-原发性LUAD及不同器官转移灶的单细胞图谱
为描述LUAD器官特异性TME的特征,研究对来自LUAD患者的配对的FFPE组织样本,进行单细胞转录组测序,聚类分析显示84,294个细胞可分为9个带有典型标记注释的聚类,包括B细胞、循环细胞、内皮细胞、上皮细胞、成纤维细胞、巨噬细胞、肥大细胞、浆细胞和T细胞(图2B-C)。
研究比较不同患者器官样本中细胞类型的比例,发现肝转移患者的免疫细胞比例较低,原发性LUAD和肾上腺转移瘤患者的B细胞、浆细胞和T细胞比例高于肝脏和脑转移瘤患者(图2D)。评估不同器官中细胞富集情况,发现浆细胞和B细胞在肾上腺转移瘤中优先富集,肥大细胞在原发性 LUAD中相对富集,循环细胞和内皮细胞分别在脑转移灶和肝转移灶中优先富集(图2E)。
对巨噬细胞、B细胞、浆细胞和T细胞进行进一步聚类细分,鉴定得到4个巨噬细胞亚群、6个T细胞亚群、3个B细胞和浆细胞亚群(图2F-H)。



图2. 原发性LUAD及不同器官转移瘤肿瘤微环境图谱

02-免疫细胞亚群的器官特异性分析
为进一步探讨LUAD的器官特异性免疫环境,研究分析了不同患者不同器官组织中巨噬细胞、T细胞等免疫细胞亚群的分布差异。结果显示SPP1+巨噬细胞的较低比例与肾上腺转移有关,IgG-浆细胞在脑转移灶和肝转移灶的富集程度较低,T细胞亚群在不同患者和部位中也存在器官特异性富集(图3)。证实了免疫细胞亚群在LUAD不同器官部位的分布差异以及信号通路的表达差异。



图3. 不同器官部位的LUAD TME中免疫细胞的多样性

03-成像质谱技术揭示LUAD TME的空间拓扑结构
研究使用40个标记的成像质谱(IMC)技术探索患者免疫细胞的空间分布,发现原发性肺转移灶和肾上腺转移灶中的B细胞以及记忆CD4+T细胞显著富集,具有相似的免疫环境;而脑转移灶和肝转移灶的免疫环境类似,相关免疫细胞相对匮乏(图4)。同时,研究还观察到不同器官特异性的三级淋巴结构密度。在包括脑转移灶和肝转移灶的免疫抑制部位,存在I型胶原蛋白的沉积,且其中的T细胞高表达TIM-3。以上发现解析了LUAD中TME的器官特异性空间结构,并验证了单细胞测序的分析结果。



图4. IMC揭示转移性LUAD TME的空间分布结构

结语

该研究利用VITApilote®高通量FFPE单细胞转录组试剂盒,对配对的肺腺癌原发性和转移灶FFPE样本展开单细胞转录组分析,揭示了肺腺癌中器官特异性肿瘤微环境的复杂性,表明肺腺癌对免疫治疗的反应与其器官特异性肿瘤微环境密切相关,提出针对不同器官特异性肿瘤微环境开发相应治疗策略的必要性。研究结果对于深入理解肺腺癌免疫特性并开发个性化治疗策略具有重要意义。
由M20 Genomics创新性研发的VITApilote®高通量FFPE单细胞转录组试剂盒,可对传统单细胞测序技术难以实现的FFPE样本展开高分辨率的单细胞转录组分析,极大拓展了单细胞测序在临床FFPE样本上的应用。自该产品问世以来,凭借创新性的数据发现和高质量的检测数据,为众多科研人员带来更广阔的科研应用前景,成为推动生命科学领域不断创新的强大动力。



图5. VITApilote®高通量FFPE单细胞转录组产品

参考文献:
1. Sun X, Teng X, Liu C, et, al. (2024) A Pathologically Friendly Strategy for Determining the Organ-specific Spatial Tumor Microenvironment Topology in Lung Adenocarcinoma Through the Integration of snRandom-seq and Imaging Mass Cytometry. Advanced Science:e2308892.
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发表于 2024-9-18 18:46 | 显示全部楼层
一图读懂病理诊断
病理诊断做什么?
什么情况下病理诊断?

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发表于 2024-9-18 18:47 | 显示全部楼层
做好切片,镜检,读片,给一个正确的结果和结论。
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