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[液体活检] CTC全基因组测序在前列腺癌中的研究

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发表于 2015-10-31 00:38 | 显示全部楼层 |阅读模式

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今天,给大家分享的是一项来自Nat Biotechnol上的研究。我们知道CTC之所以具有被寄予厚望的临床应用价值,根本原因在于它是对原发灶和转移灶信息的反映。它与肿瘤组织病灶之前到底有怎样的关系呢,这项来自前列腺癌的研究给我们提供了参考。

该研究主要是对前列腺癌患者分别进行原发灶、转移灶以及CTC水平上不同突变位点的检测。其中CTC捕获后进行全基因组扩增然后对外显子测序。其中一例转移性前列腺癌患者原发灶检测样本是来自于五年前的冰冻组织样本,转移灶样本选择的是在CTC取样前5个月时的切除的颈部淋巴结样本。该患者为原发灶多发性,所以最后选择了9个不同位置的原发灶作为检测样本。研究结果1:转移灶中所测的91个位点中,有47个(51%)与CTC中所测一致。2:在对比五年前原发灶的信息时发现,其中一个Gleason5级的原发灶的信息与转移灶和CTC上的信息大体一致。这一结果似乎暗示了,这一个特定的原发灶也许是CTC的起源。3:研究进一步发现,包括TP53在内的10个位点信息存在于所有的原发灶和转移灶中,显示出癌症起源的共性,CTC中包含9个相同的位点信息。
4:56个突变同时存在于转移灶及任一原发灶中,CTC中含有41个(73%)。
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研究讨论在这个研究中,我们看到单个CTC外显子测序显示出CTC的突变和转移灶具有较高的相似性。而对不同位点的原发灶的测序中,发现CTC主要源于其中的一个位点。这个发现对于我们进一步研究揭示CTC溯源问题提供了很好的一个参考。

另外最关键的信息是,我们知道在这项研究中,原发灶是取材于5年前的冰冻样本,CTC是新近检测。而CTC仍然保留了原发灶中那些可以被称之为“早期”型的突变位点信息,这些共同的信息也存在于转移灶中。从这里我们可以看出,CTC在原发灶和转移灶之间承接了桥梁的作用,不仅保有原发灶的初始信息并将其传递至转移灶,同时,也在时空上反映了此后的变化信息,即原发灶之外的新的信息。这对于我们进一步研究肿瘤患者的转移机制、用药敏感性等提供了基础参考依据。

来源:莱尔生物



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