分子病理检查-NGS项目检查位点

2025-2-8 10:22| 编辑: 归去来兮| 查看: 852| 评论: 0|来源: 安徽医科大学病理中心

摘要: 分子病理检查-NGS项目检查位点

肠癌：

▎DNA检测基因列表

APC	BMPR1A	BRAF	C8orf34	CDH1	CTNNB1
CYP19A1	DPYD	EPCAM	ERBB2	ERCC1	FBXW7
GREM1	KIT	KRAS	MLH1	MSH2	MSH6
MUTYH	NQO1	NRAS	NTHL1	PDGFRA	PIK3CA
PMS2	POLD1	POLE	PTEN	SDHB	SDHC
SDHD	SEMA3C	SMAD4	STK11	TP53	TYMS
UGT1A1

▎RNA检测基因列表

Kinase(exon)	Partner Gene(exon)
*ALK(19,20)*	CLTC(31) EML4(2,3,6,13,14,15,17,18,20) HIP1(21,28,30) KIF5B(15,17,24) KLC1(9) MSN(11) STRN(3) TFG(4,5,6) TPM3(8) TPR(15)
*RET(8,11,12)*	CCDC6(1) CUX1(10) KIF5B(15,16,22,23,24) NCOA4(7,8) PRKAR1A(7) TRIM33(11,14)
*ROS1(32,34,35,36)*	CCDC6(5) CD74(6) CLTC(31) EZR (10) GOPC(4,8) LRIG3(16) MSN(9) SDC4(2,4) SLC34A2(4,13) TFG(4) TPM3(8)
*NRG1(4,6)*	CD74(6,8) SLC3A2(5) VAMP2(4)
*PBX1(3)*	TCF3(16)
*FGFR3(17)*	BAIAP2L1(2) TACC3(4,8,9,10,11)
*FGFR2(17)*	BICC1(3) CASP7(3)
*EGFR(1,24)*	GFR(8) PSPH(8) RAD51(4) SPET14(10)
*NTRK1(9,10,11,12,13)*	ARHGEF2(21) BCAN(13) CD74(3) CHTOP(5) IRF2BP2(1) LMNA(2,6,11) MPRIP(14,18,21) NFASC(21) PPL(22) SCYL3(11) SQSTM1(5) TFG(5) TP53(11) TPM3(8) TPR(6)
*NTRK2(12,13,15,16,17)*	AFAP1(14) BCR(1) NACC2(4) PAN3(4) QKI(6) SQSTM1(5) TRIM24(12)
*NTRK3(14,15)*	BTBD1(4) EML4(2) ETV6(4,5) RBPMS(5) SQSTM1(5) TFG(6)
*BRAF(9,11)*	AKAP9(8) FAM131B(2,3) KIAA1549(14,15) MKRN1(4)
*RAF1(6,8,10)*	ESRP1(13) SRGAP3(11,12)
*MET(14,15)*	KIF5B(24) Exon-skipping
*PPARG(2)*	PAX8(7,8,9,10) CREB3L2(2)
*ERG(2,4)*	TMPRSS2(1,2)
*PRKACA(2)*	DNAJB1(1)
*TFE3(4,5,6)*	ASPSCR1(7) CLTC(17) NONO(9) PRCC(1,2,4) SFPQ(7,9)

肺癌：

▎DNA检测基因列表

ABL1	CTNNB1	FGFR3	IDH2	MPL	PIK3CA
AKT1	DDR2	FLT3	JAK2	MYC	PTEN
ALK	EGFR	FOXL2	JAK3	NOTCH1	PTPN11
APC	ERBB2	GNA11	KDR	NPM1	RAC1
ATM	ERBB4	GNAQ	KIT	NRAS	RB1
BRAF	EZH2	GNAS	KRAS	NTRK1	RET
CDH1	FBXW7	HNF1A	MAP2K1	NTRK2	ROS1
CDKN2A	FGFR1	HRAS	MET	NTRK3	SMAD4
CSF1R	FGFR2	IDH1	MLH1	PDGFRA	SMARCB1
SMO	SRC	STK11	TP53	VHL	CCNE1
SRY	POLE	TERT

▎RNA检测基因列表

Kinase(exon)	Partner Gene(exon)
*ALK(19,20)*	CLTC(31) EML4(2,3,6,13,14,15,17,18,20) HIP1(21,28,30) KIF5B(15,17,24) KLC1(9) MSN(11) STRN(3) TFG(4,5,6) TPM3(8) TPR(15)
*RET(8,11,12)*	CCDC6(1) CUX1(10) KIF5B(15,16,22,23,24) NCOA4(7,8) PRKAR1A(7) TRIM33(11,14)
*ROS1(32,34,35,36)*	CCDC6(5) CD74(6) CLTC(31) EZR (10) GOPC(4,8) LRIG3(16) MSN(9) SDC4(2,4) SLC34A2(4,13) TFG(4) TPM3(8)
*NRG1(4,6)*	CD74(6,8) SLC3A2(5) VAMP2(4)
*PBX1(3)*	TCF3(16)
*FGFR3(17)*	BAIAP2L1(2) TACC3(4,8,9,10,11)
*FGFR2(17)*	BICC1(3) CASP7(3)
*EGFR(1,24)*	GFR(8) PSPH(8) RAD51(4) SPET14(10)
*NTRK1(9,10,11,12,13)*	ARHGEF2(21) BCAN(13) CD74(3) CHTOP(5) IRF2BP2(1) LMNA(2,6,11) MPRIP(14,18,21) NFASC(21) PPL(22) SCYL3(11) SQSTM1(5) TFG(5) TP53(11) TPM3(8) TPR(6)
*NTRK2(12,13,15,16,17)*	AFAP1(14) BCR(1) NACC2(4) PAN3(4) QKI(6) SQSTM1(5) TRIM24(12)
*NTRK3(14,15)*	BTBD1(4) EML4(2) ETV6(4,5) RBPMS(5) SQSTM1(5) TFG(6)
*BRAF(9,11)*	AKAP9(8) FAM131B(2,3) KIAA1549(14,15) MKRN1(4)
*RAF1(6,8,10)*	ESRP1(13) SRGAP3(11,12)
*MET(14,15)*	KIF5B(24) Exon-skipping
*PPARG(2)*	PAX8(7,8,9,10) CREB3L2(2)
*ERG(2,4)*	TMPRSS2(1,2)
*PRKACA(2)*	DNAJB1(1)
*TFE3(4,5,6)*	ASPSCR1(7) CLTC(17) NONO(9) PRCC(1,2,4) SFPQ(7,9)

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