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测序仪界的“台式机”之争:MiSeq i100 vs DNBSEQ-E25

2024-12-4 10:20| 编辑: 归去来兮| 查看: 395| 评论: 0|来源: 基因Create

摘要: 很久没有这么热闹了,国内外的测序仪玩家扎堆发新品。


很久没有这么热闹了,国内外的测序仪玩家扎堆发新品。9月初先是国内的几家小玩家赛陆、真迈在小机型赛道推陈出新;紧接着9月9日,华大发布了纸巾盒大小的纳米孔基因测序仪CycloneSEQ-WT02;国庆假期前,行业老大哥illumina抛出了海报,“一小部,一大步”,让人感觉今年或许是测序仪界“台式机”的大争之年?10月9日,谜底揭晓,illumina发布MiSeq家族的最新姐妹花 i100和i100 Plus,看个头也不算小了.....


MiSeq i100 VS DNBSEQ-E25

先来说下营销端的亮点,可以看到的是,i家全新升级的“第2代”产品家族形象已经基本稳定下来:

NovaSeq,NextSeq和Miseq

曾经的第1代和第1.5代产品外观或许均将成为历史

但是新机的型号命名却是其唯一一款在机型和数字中间格外加了字母i的,可能会让人跟iSeq混淆,或者是故意希望大家忘记iSeq的.....

i 家的桌面测序仪新老产品一览

接着让我们来看下产品本身:i100延续了自iSeq而来的使用CMOS替代相机拍照以及集成式的一体化试剂盒技术,全干式设计,下机无需清洗,20分钟内可以完成上机操作。不过有一说一,发布会上illumina一众高管只展示了集成了CMOS的测序卡盒,给人一种集大成于一身的错觉。但实际上机仍然是老三样,这几乎是近几年新发布的测序仪的标配1-载片、2-试剂盒、3-废液桶,虽然外观设计上确实看上去更加精致,但并没有特别大的创新。

感觉i100是一只“大号”的E25,二者在多个方面的相似度都很高↓

其次,是i家一贯喜欢的姐妹花套路,一如当年的HiSeq 3000/4000, NovaSeq 5000/6000,NextSeq 1000/2000,NovaSeq X和NovaSeq Plus(最后真正受欢迎、活下来的往往只是其中之一),在这次的i100和i100 Plus的芯片卡盒上预留了黑色的“芯片位”,但是二者的仪器价格差了60K美金,这个中间的差价就不知道是谁占谁的便宜了......

在微流控芯片卡盒上的芯片和“预留的”芯片位(金色区域和黑色区域)

从i100的配套耗材成本来讲,从参数表上可以看到,不同通量的耗材在测序时间上相差不大,这里i100采用CMOS技术的优势开始显现,运行时间不会因为数据产出(拍照面积)的翻倍而显著增加,而是仅在流体等方面稍有区别。在其当前的性能规划中,不提供5M SE100和100M PE300,其中前者应该是考虑到相较于25M SE100,5M SE100不会在时间及成本上有太大优势;后者猜测是试剂量无法与其他读长共用,同时16S测序对于通量的要求50M足够的原因。但无论如何,i100只有在plus机型才会提供50M和100M的配套耗材,而且要在2025年才能正式供应。 

i100性能参数

总的来说,i100的这次发布从型号命名和原理来看接近iSeq,性能表现和产品定位照着MiSeq老机子在打,外观是迷你版的NovaSeq,原理升级为最新的XLEAP-SBS,给人的感觉是略显匆忙的“大杂烩”,把各种优点堆在一起,而且发布会上的early user没能拿出测试数据让大家一睹“芳容”,估计也是还没有真的外部用户上机实测,所以给人的感觉更像是着急赶出来的一场发布会。

当然,谁都没有准备得非常完美的时候,想必i家推出这款新品,也是“众望所归”,虽然打了折扣,略显平淡;以及在过于殷切的期望之下没有看多新东西的淡淡失落。

早在今年年初的AGBT上大家就在问,illumina为啥一直没动作啊,毕竟在Ultima, Element和Singular积极出招的同时,MGI的各种创新尝试也是一直不断,包括华大这两年一直处于引领地位的时空组学测序,以及今年4月推出的MGISEQ-2000一机双用版FluoXpert蛋白染色成像一体机,让测序和染拍可以在同一台设备上实现。

此外作为一家欧美公司,i家在现环保与可持续性方面一直做得很不错这一点在i100身上也得到了“普及”,益于常温试剂,整机及其配套试剂耗材在包装运输上的环境影响大大降低。虽然常温试剂已经在NovaseqX等平台使用,但是毕竟i100是针对入门级用户的产品,可以常温运输、储存试剂,用户无解冻想用就用,这对于个行业而言也是一个比较大的点(所以i家试剂贵也是有理由的.....,当然能否像E25那样真的具备山下”、在极端环境下的实战历要时间的考验

最后的最后,还是站在整个行业来看,困扰NGS技术进入更广泛应用领域的桎梏仍然存在。这次illumina的i100“一小部”还真的称不上“一大步”,充其量也只迈出了非常小的一步,按其发布会上的原话来说:可以在一个single work shift内完成从DNA开始构建肿瘤基因检测文库,到i100上机的全部流程。样本前处理与文库构建过程仍然是进行基因测序的必须步骤,对于广泛的临床应用仍然是巨大的挑战。测序快是快了,但仍然没有逃离白天建库,夜里测序,第二天出结果的框架,看不到任何质的提升。

目前,业内开展基因测序的成本仍然在百美元的量级(最低400美元起),仍然远高于qPCR、生化免疫、胶体金等技术手段。作为测序行业从业者,我们已经习惯了illumina作为行业引领者一路创立标杆,定义规则,这次是不是我们对他的期望或许太高了呢?巧合的是,在今年9月华为Mate XT非凡大师和苹果iPhone 16系列手机在同时召开新品发布会之后,也均选在同一时间正式开售。猜猜看,测序仪厂家/品牌商距离手机厂家/牌商还有多远的距离?

——彩蛋环节——

大家今年都在“卷”的关键词都有哪些?

小,快,全,简便

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