炎症性肠病(IBD)是胃肠道慢性炎症性疾病的总称,克罗恩病(CD)和溃疡性结肠炎(UC)是两种主要表型,未分类IBD(IBD-U)是具有结肠IBD特征但无法进一步区分的患者。 本研究的目的是分析不同病程、活动度和治疗暴露的多个欧洲患者队列的炎症血清蛋白,以描述IBD谱的异质性,并确定与潜在分子亚型相关的鉴别模式。
本文旨在评估基于炎症血清蛋白的IBD谱,并在多个欧洲队列中确定潜在生物学亚型的判别模式。使用Olink炎症panel(Olink蛋白质组学),作者检测了1551例IBD患者和312名健康对照(HC)的86种炎症相关血清蛋白。 作者筛选了IBD亚型之间以及IBD和HC之间表现出显著差异的蛋白质。采用分类模型鉴别克罗恩病(CD)和溃疡性结肠炎(UC),基于概率评分探索IBD的疾病谱。与HC相比,在UC和所有CD表型中,29种炎症相关蛋白的水平显著较高,而只有成纤维细胞生长因子(FGF)-19的水平显著较低。与HC相比,在所有CD表型和UC中,FGF-19仍然显著较低,即使在针对年龄、性别、病程进行校正并排除有IBD相关手术史的患者后也是如此。此外,与HC相比,在结肠炎症(UC、结肠型CD和回结肠型CD)患者中,C-X-C基序趋化因子(CXCL)10、C-C基序趋化因子(CCL) 11、IL-10和IL-17A的相对水平显著较高。总之,多种蛋白(如IL-17A、MMP-10和FGF-19)的水平存在差异(foldchange>1.2;FDR<0.05)差异有统计学意义。 使用PLR和RF建立了区分CD和UC的蛋白质模型,并进行了留一法(一种交叉验证方法)。使用多变量模型,作者确定了一个反映IBD谱的蛋白质标签,将结肠CD定位于UC和回肠CD之间,两者在谱的两端。在CD vs UC模型中选择和形成作者观察到的光谱的最重要的蛋白质包括IL-17A、MMP-10、FGF-19、IL-10、信号传导淋巴细胞活化分子(SLAMF1)、CXCL10和C-C基序趋化因子CCL-4,如图3 B中显示的模型系数框图所示: 基于曲线下面积(AUC)估计,分类模型更准确地鉴别UC和回肠CD(中位AUC为>0.73),而结肠CD(中位AUC <0.62)。鉴别结肠和回肠CD的模型表现中等(中位AUC为0.67 ~ 0.69)。 在这项对来自多个欧洲队列的1,800名>个体进行的全面横断面研究中,作者描述了不同亚型IBD的炎症血清蛋白图谱。作者的结果表明,在CD和UC的总体蛋白质谱中缺乏明确的分离,因为与对照组相比,两个主要亚型共享一些水平显著改变的蛋白质。相反,作者发现了从回肠CD到结肠CD再到UC的一系列IBD表型。结肠型和回肠型CD的血清蛋白表达差异明显高于结肠型CD和UC。 杭州乐为生医科技有限公司可提供抗体寡核苷酸偶联技术服务及成品试剂盒。助力您在实验室条件下即可轻松实现Ab-oligo的高效偶联。
技术支持联系:18611591243 销售联系:19957893538 【微信同号 欢迎来电咨询】 【参考文献】 Salomon B, Sudhakar P, Bergemalm D, Andersson E, Grännö O, Carlson M, Hedin CRH, Söderholm JD, Öhman L; BIO IBD consortium; COLLIBRI consortium; Lindqvist CM, Kruse R, Repsilber D, Verstockt B, Vermeire S, Halfvarson J. Characterisation of IBD heterogeneity using serum proteomics: A multicentre study. J Crohns Colitis. 2024 Nov 4:jjae169. doi: 10.1093/ecco-jcc/jjae169. Epub ahead of print. PMID: 39495605.
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