上周五晚,陈力老师在《分析微生物学及临床应用》的课群中,发了一个小通知:“10月12日(周六)补国庆长假10月7日的课,课上点名”。 真要点名?不是的,因为昨天授课的主要内容为纳米孔测序。这个技术的最主要特点,就是点名,或是“孔口点名”。 虽然纳米孔测序技术问世才十年左右,已然成为分析微生物学的内容。陈力老师每年都会邀请国内外企业专家(牛津纳米孔,齐碳,先声,华大等)来课堂分享第一线的实战经验。今年请到的,是安序源的涂浩波涂总。在加入安序源之前,涂总曾在先声,Genskey等公司任职。 涂总从技术,应用,及展望三个方向介绍了纳米孔测序技术。细节包括原理,过程,构件,主要技术参数,技术流派(解旋单链信号/合成标记信号)及特点,临床应用,对标产品等。他还分享了自己所看到的主要问题和挑战。 分享之后,课程进入讨论环节。陈力老师首先谈了他对纳米孔测序的看法。他说,在基础微生物的细菌学部分,大家都学过细菌有个F因子。具有这个F因子的细菌可以建一个性鞭毛(F鞭毛,将自己的DNA,输注到近旁的细菌之中)。这个F因子,就是天然的纳米孔,通过纳米孔输出的DNA可以在两百万个碱基对以上。而纳米孔测序,就是在输出端的端口上加一个GATC信号孔口点名。所以,纳米孔测序的主要特点,就是长序,多通道和实时组装。 课上的讨论热点还包括:扬其(纳米测序)长(快/长),抑其短(准确)的临床应用,例如,肠道菌群分析?个体全测序?及微生物信号富集(特异/非特异)技术,以及DNA/RNA/蛋白质测序等。 编辑:吕绍衔 |