点名与纳米孔测序

上周五晚，陈力老师在《分析微生物学及临床应用》的课群中，发了一个小通知：“10月12日（周六）补国庆长假10月7日的课，课上点名”。

真要点名？不是的，因为昨天授课的主要内容为纳米孔测序。这个技术的最主要特点，就是点名，或是“孔口点名”。

虽然纳米孔测序技术问世才十年左右，已然成为分析微生物学的内容。陈力老师每年都会邀请国内外企业专家（牛津纳米孔，齐碳，先声，华大等）来课堂分享第一线的实战经验。今年请到的，是安序源的涂浩波涂总。在加入安序源之前，涂总曾在先声，Genskey等公司任职。

涂总从技术，应用，及展望三个方向介绍了纳米孔测序技术。细节包括原理，过程，构件，主要技术参数，技术流派（解旋单链信号/合成标记信号）及特点，临床应用，对标产品等。他还分享了自己所看到的主要问题和挑战。

分享之后，课程进入讨论环节。陈力老师首先谈了他对纳米孔测序的看法。他说，在基础微生物的细菌学部分，大家都学过细菌有个F因子。具有这个F因子的细菌可以建一个性鞭毛（F鞭毛，将自己的DNA，输注到近旁的细菌之中）。这个F因子，就是天然的纳米孔，通过纳米孔输出的DNA可以在两百万个碱基对以上。而纳米孔测序，就是在输出端的端口上加一个GATC信号孔口点名。所以，纳米孔测序的主要特点，就是长序，多通道和实时组装。

课上的讨论热点还包括：扬其（纳米测序）长（快/长），抑其短（准确）的临床应用，例如，肠道菌群分析？个体全测序？及微生物信号富集（特异/非特异）技术，以及DNA/RNA/蛋白质测序等。

编辑：吕绍衔