IVD开发 | 乳腺癌ctDNA检测产品资料

    乳腺癌是全球女性中最常见的恶性肿瘤之一，早期诊断和监测对于提高患者生存率至关重要。循环肿瘤DNA（ctDNA）作为一种无创性生物标志物，近年来在乳腺癌的早期检测、治疗监测和预后评估中显示出巨大的潜力。该产品是一种基于液体活检技术的乳腺癌循环肿瘤DNA(ctDNA)检测试剂盒。它可以从患者外周血液样本中检测到来自肿瘤细胞的游离DNA片段,从而无创性地监测肿瘤的遗传变异情况。

在早期乳腺癌中：

    乳腺癌的早期诊断和监测对于提高患者生存率至关重要。ctDNA作为一种无创性生物标志物，近年来在乳腺癌的早期检测、治疗监测和预后评估中显示出巨大的潜力。多项研究表明，ctDNA水平与肿瘤大小和淋巴结受累情况相关。术后ctDNA水平的下降与良好的治疗反应相关，而ctDNA的持续存在则预示着较高的复发风险。

在转移性乳腺癌中：

    转移性乳腺癌（MBC）患者的治疗监测和预后评估是临床中的一大挑战。液体活检提供了一种实时评估肿瘤负荷和分子特征的方法。ctDNA检测在MBC患者中显示出较高的灵敏度和特异性。研究表明，ctDNA水平或基因变异数量与预后密切相关，能够用于治疗选择和监测。

ctDNA检测技术的进展：

    ctDNA检测技术包括数字PCR（ddPCR）、高通量测序（NGS）和甲基化分析等。每种技术在灵敏度、特异性和应用场景上各有优势。研究表明，NGS技术能够同时检测多种基因突变，适用于全面的基因组分析，而ddPCR则在低频突变检测中表现出色。

1. 早期筛查

 高危人群: 包括有家族史或基因易感性的人群。这些人群由于遗传因素，患乳腺癌的风险较高，早期筛查有助于早期发现和干预。

    无症状人群: ctDNA检测作为一种无创性方法，可以用于无症状人群的早期筛查，特别是那些在常规影像学检查中未发现异常但仍有风险的人群。

2. 治疗监测

已确诊的乳腺癌患者: 用于监测治疗效果和耐药性。通过动态监测ctDNA水平，可以评估患者对治疗的反应，及时调整治疗方案。    

    新辅助治疗患者: 在新辅助化疗或靶向治疗期间，通过ctDNA检测可以评估治疗效果，预测病理完全缓解（pCR）率。

3. 预后评估

复发风险评估: ctDNA检测可以用于评估患者的复发风险。研究表明，术后ctDNA阳性与较高的复发风险相关，早期检测到ctDNA可以提示潜在的复发。

    长期随访: 对于完成初始治疗的患者，ctDNA检测可以用于长期随访，监测微小残留病（MRD），以便早期发现复发并进行干预。

    基因突变: 如TP53、ESR1、PIK3CA、AKT1、HER2等。

1. PIK3CA：PIK3CA基因突变是乳腺癌中最常见的突变之一，尤其在激素受体阳性（HR+）和HER2阴性（HER2-）的乳腺癌患者中。PIK3CA突变与肿瘤的生长和存活密切相关，常用于评估肿瘤的治疗反应和预后。

2. TP53：TP53基因突变在多种癌症中都很常见，包括乳腺癌。TP53突变通常与肿瘤的侵袭性和不良预后相关。检测TP53突变可以帮助识别高风险患者，并指导个性化治疗方案。

3. ESR1：ESR1基因突变主要出现在接受内分泌治疗的乳腺癌患者中，尤其是那些对芳香化酶抑制剂产生耐药的患者。ESR1突变的检测有助于评估内分泌治疗的效果和耐药性。

4. HER2：HER2基因扩增或突变在HER2阳性乳腺癌患者中非常重要。HER2状态的检测对于选择抗HER2靶向治疗（如曲妥珠单抗）至关重要。ctDNA检测可以实时监测HER2状态的变化，指导治疗调整。

5. BRCA1/BRCA2：BRCA1和BRCA2基因突变与乳腺癌的遗传易感性密切相关。携带这些突变的患者通常具有较高的乳腺癌风险。BRCA突变的检测不仅用于风险评估，还可以指导PARP抑制剂等靶向治疗。

6. PTEN：PTEN基因突变在乳腺癌中相对少见，但其存在与肿瘤的侵袭性和不良预后相关。PTEN突变的检测可以帮助识别特定的治疗靶点，并评估治疗效果。

7. AKT1：AKT1基因突变在乳腺癌中也有一定的发生率，尤其是在激素受体阳性（HR+）的乳腺癌患者中。AKT1突变的检测有助于指导靶向治疗，如AKT抑制剂。

8. FGFR1/2/3：FGFR基因家族的突变或扩增在乳腺癌中也有报道，尤其是在激素受体阳性（HR+）和HER2阴性（HER2-）的乳腺癌患者中。FGFR突变的检测可以帮助识别潜在的治疗靶点，并指导靶向治疗。

    甲基化标志物: 甲基化模式可以反映特定癌症的表观遗传起源，具有较高的信号丰富度和强度。

1. RASSF1A：RASSF1A基因的甲基化在多种癌症中都有报道，尤其是在乳腺癌中。RASSF1A的甲基化状态可以作为乳腺癌的早期诊断和预后评估的标志物。研究表明，RASSF1A甲基化在乳腺癌患者的ctDNA中具有较高的检测率和特异性。

2. BRCA1：BRCA1基因的甲基化在乳腺癌中也非常重要，尤其是在三阴性乳腺癌（TNBC）患者中。BRCA1甲基化与肿瘤的侵袭性和不良预后相关。检测BRCA1的甲基化状态可以帮助识别高风险患者，并指导个性化治疗方案。

3. PIK3CA：PIK3CA基因的甲基化在乳腺癌中较为常见，尤其是在激素受体阳性（HR+）和HER2阴性（HER2-）的乳腺癌患者中。PIK3CA甲基化的检测有助于评估肿瘤的治疗反应和预后。

4. TP53：TP53基因的甲基化在多种癌症中都有报道，包括乳腺癌。TP53甲基化通常与肿瘤的侵袭性和不良预后相关。检测TP53的甲基化状态可以帮助识别高风险患者，并指导个性化治疗方案。

6. HOXB4：HOXB4基因的甲基化在乳腺癌中也有报道。HOXB4甲基化与肿瘤的侵袭性和不良预后相关。检测HOXB4的甲基化状态可以帮助识别高风险患者，并指导个性化治疗方案。

7. COL6A2：COL6A2基因的甲基化在乳腺癌中较为常见。COL6A2甲基化的检测有助于评估肿瘤的治疗反应和预后。

8. GPX7：GPX7基因的甲基化在乳腺癌中也有报道。GPX7甲基化与肿瘤的侵袭性和不良预后相关。检测GPX7的甲基化状态可以帮助识别高风险患者，并指导个性化治疗方案。

9. TM6SF1：TM6SF1基因的甲基化在乳腺癌中较为常见。TM6SF1甲基化的检测有助于评估肿瘤的治疗反应和预后。

10. ARHGEF7：ARHGEF7基因的甲基化在乳腺癌中也有报道。ARHGEF7甲基化与肿瘤的侵袭性和不良预后相关。检测ARHGEF7的甲基化状态可以帮助识别高风险患者，并指导个性化治疗方案。

    其他标志物: 如拷贝数变异（CNV）、微卫星不稳定（MSI）等。

1. 拷贝数变异（Copy Number Variation, CNV）是指基因组中某些区域的DNA片段在个体间存在拷贝数的差异。这种变异可以导至基因的扩增或缺失，从而影响基因的表达和功能。可通过低深度全基因组测序（LP-WGS）、低深度全基因组测序（LP-WGS）或数字PCR（dPCR）检测。CNV的检测可以用于评估乳腺癌患者的预后。例如，ERBB2（HER2）基因的扩增与HER2阳性乳腺癌相关，预示着较差的预后。还可以指导个性化治疗方案。例如，CCND1基因的扩增与细胞周期调控相关，可以作为靶向治疗的潜在靶点。

2. 微卫星不稳定（Microsatellite Instability, MSI）是指由于DNA复制时插入或缺失突变引起的微卫星序列长度的改变。MSI通常由错配修复（MMR）系统的缺陷引起。可通过PCR+毛细管电泳或NGS检测。MSI状态与某些免疫检查点抑制剂的反应/耐药性相关。MSI-H（高度微卫星不稳定）肿瘤患者通常对免疫治疗有较好的反应。还可以作为乳腺癌患者预后的一个重要指标。MSI-H状态通常与较好的预后相关。

    ESMO指南：欧洲肿瘤内科学会(ESMO)在其2022年乳腺癌临床实践指南中推荐,在转移性乳腺癌患者中常规使用ctDNA检测,以指导分子靶向治疗。指南强调了ctDNA在以下方面的应用: 检测PIK3CA、ESR1等基因突变,指导相应靶向药物的选择；动态监测ctDNA突变谱的变化,了解获得性耐药机制；ctDNA水平变化可预测患者对治疗的反应。

    NCCN指南：美国国家综合癌症网络(NCCN)在其2023年乳腺癌指南中,建议对HER2阴性、激素受体阳性的晚期乳腺癌患者评估PIK3CA突变情况。指南推荐ctDNA检测作为组织基因检测的补充工具。同时指出在组织样本不足或患者不适合重复活检时,ctDNA检测尤为重要。

    ASCO指南：美国临床肿瘤学会(ASCO)在2022年发布的指南中,建议对转移性乳腺癌患者进行ctDNA检测,用于监测疾病进展和指导治疗决策。指南认为ctDNA检测可提供有价值的临床信息,有助于个体化治疗。    

    SEOM指南：西班牙医学肿瘤学会(SEOM)在2021年发布的指南中,推荐在转移性乳腺癌患者中使用ctDNA检测。指出ctDNA检测可用于早期发现获得性耐药,并指导后续治疗方案的调整。

    NICE指南：英国国家卫生与临床优化研究所(NICE)在2018年发布的指南中,建议对转移性乳腺癌患者进行ctDNA检测,用于监测疾病进展。指出ctDNA检测是一种非侵入性的监测方法,可避免频繁的组织活检。

    CSCO指南：中国临床肿瘤学会(CSCO)在2021年发布的指南中,推荐在转移性乳腺癌患者中使用ctDNA检测。指出ctDNA检测可用于指导靶向治疗的选择,并监测治疗反应。

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• 肿瘤DNA甲基化标志物检测及临床应用专家共识（2024版）