把测序仪作为一个多组学平台,是我们早就聊过的技术路径。 甚至,Singular Genomics还想靠着这个打法翻身。 有兴趣的,可以参考这一篇看看。 包括新秀Element Biosciences,也在准备将自家的测序仪AVITI升级到AVITI24这个多组学平台。 只不过,没想到的是,最早商业化的竟然是...华大智造!
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2024年4月11日,MGI华大智造在上海2024 CMEF(中国国际医疗器械博览会)上宣布:MGISEQ-2000革命性升级。 一般所谓升级,基本上就是意味着新一代机型出现了,甲方爸爸该掏钱买新机器了。 然而,这次不一样。 ![](data/attachment/portal/202404/15/134355hu5nuuk8zuw5og0l.png)
华大智造表示,不用添置任何硬件就能得到一台既能测序又能做mIF(多重荧光)的多组学平台! 所以,我们更愿意把这个升级用另外一个词来表示:旧改。 ![](data/attachment/portal/202404/15/134355kzjkpmf4cfp1mfve.png)
一般的旧改,是指旧城改造;华大智造的旧改,是对旧测序仪的全新改善、提升。 通过对测序仪有步骤的改造,延展测序仪的使用边界,打造一个多组学的平台,这就是测序仪的旧改。 那么,我们来看看,华大智造的MGISEQ-2000是怎样的一个“喜加一”。
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MGISEQ-2000是一台测序仪(废话),但是仅仅通过软件升级它就变成了一个拥有测序和多重免疫荧光染色技术的MGISEQ-2000 FluoXpert了。 既然测序这部分我们很熟悉了,咱们主要来看多重免疫荧光部分。 ![](data/attachment/portal/202404/15/134355uzdgxsnpv0gpviq9.png)
拥有三种规格的载片,即15mm*15mm的SS(Solo Small)、15*16mm的SL(Solo Large)和20mm*70mm的DL(Dual Large)。 当然,这个面积都是指扫描成像区域。 ![](data/attachment/portal/202404/15/134355me3jpejeh3gyjyew.png)
标准提供6重的检测试剂盒,一抗自选,最高支持24重检测靶标的定制。 通量是6重多标荧光检测是4.5-5h完成一轮,支持双载片上机,这么算下来一天能处理两轮,4张载片,一周28张没问题。 哦,对,我是一周按照7天算的(官方5天),怎么可能一周才5天呢(手动狗头)。 ![](data/attachment/portal/202404/15/134355gddf0fdypfd72p0g.png)
只不过,由于测序和多重免疫荧光的控制软件是互斥的,目前没有办法一边测序一边做mIF。 (真的没有办法同时存在么?我不信...想想办法嘛 ![](data/attachment/portal/202404/15/134355ziwxx17v7a8728vu.png) )华大智造贴心的给出了一周NGS+mIF的应用场景工作流。 这也提示了我们,旧改后的MGISEQ-2000最可能的应用场景。
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MGISEQ-2000的mIF结果与IHC结果无显著差异,也就是说,其可以完全用于组织病理学的研究。 比如大热的肿瘤微环境研究:肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)的组成及细胞间相互关系进行分析, 并给出具有统计学意义的细胞组学数据。 这个事吧,Akoya做了很多年了。 Akoya:首先,我没有惹你们测序仪... ![](data/attachment/portal/202404/15/134355m3kciiiqzfb3l3ki.png)
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再次说明一个问题,打败Akoya的可能不是另一家多重免疫荧光厂家,而是测序仪厂商... ![](data/attachment/portal/202404/15/134355m95nsos2jlmmbjhl.png)
不过,他们家的TAM(total addressable market,可触达市场)可以拿来参考下。 根据Akoya的估算,仅科研应用mIF的市场就有30亿美元。 而转化研究和临床应用,又可以带来110亿美元的庞大市场。 国内,已经有艾克发、百诺全景、阔然等公司试图将mIF产品推入临床市场。 只不过,MGISEQ-FluoXpert的到来,让这一切产生了新的变数。 我们似乎能想象这么一个场景: 主任:我要买台测序仪,做多标染色用。 院长:你确定没写错? 主任:没错,就是MGISEQ-2000,测序/mIF两开花 院长:...要不测序这块责任你也担起来? 主任: ![](data/attachment/portal/202404/15/134355dv898l9ip922p9i7.png)
当然,上面这个场景的实现,依赖着对mIF应用的深入挖掘。 包括但不限于与空间转录组的结合、与临床需求的结合,同时还要依赖工具的进步与升级。 对临床应用而言,多标不应该是简单的叠加,而是要有明显的诊断意义。 这就需要科研的深入研究,合作伙伴的共同来开发,来推动形成标准化的产品。 在这里,我们大胆做个推论吧: 第一,MGISEQ-2000 FluoXpert未来还可能升级,比如增加检测载片类型,增加检测靶标数量等。 第二,MGISEQ-2000 FluoXpert这种旧改模式可能是MGI华大智造的一种新探索,如果效果不错,不排除更多旧机型纳入旧改的可能。 第三,要是市场反馈好,二手MGISEQ-2000可能涨价。 猜对点赞,猜错了后台/留言打脸。
相关资料: 注1:https://www.mgi-tech.com/Download/download_file_new/id/452 注2:发布会视频截图(侵删)
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