纳米孔测序进入“暗黑”模式

虽然已经不热了，但发现国内没有其他媒体报道，还是来分享一下。

起因是ONT 在其社群网站上发布了有关新测序模式的更新，适用于其所有流通池系列。这种新模式下孔利用率提升，从而提高了测序运行的通量和数据产量。

这权且称之为“暗黑模式”。做法都很简单，把流通池测序区域遮上避光，一旦加载样品开始测序，用户可以盖上盖子或者用其他方式覆盖这个区域。

这不是什么新奇的技术更新，只是通过遮避光来避免纳米孔测序体系在测序运行中受到影响。（所以，如题，不是标题党。）

ONT提示，特别是应用的 MinION 流通池上的较短读取时，产量提**469%，而对于其他不同的测序组合也都有10%到150%的提升。

ONT在其官方社群内提供了全面的说明，非ONT用户可能看不到。社群也是ONT引以为豪的地方，不管是ONT还是其用户经常会在这里分享一些技术更新、操作改进或其他创新的尝试。

这个对话，hhh...

“暗黑”模式一发布，大家就迫不及待地上手测试和验证。很多客户使用了自创的“暗黑”手段，来评估这对通量和孔寿命的影响。

如果“暗黑”真的能提升数据产量、延长孔的使用，客户一定是拍手叫好的。

“暗黑”在客户手里也出现了“奇迹”……当然，也有更多的“创新”。

光子撞击孔所在的膜，会影响孔本身的寿命和可用性。

于是就有人在问，如果减少光子的影响可以提高测序运行的质量，那么下一步是什么？是不是应该考虑地球上的不同辐射源对于纳米孔测序的影响？

除了筛选新的更快速兼顾更准确的马达蛋白之外，ONT在LC23上已经提到了缓冲液成分的迭代改进可以减少孔的阻滞及DNA相互之间的作用，进而提升产量（30%以上）。

每个PromethION流通池已经能稳定产出100G以上的Q20+数据，实现690美元的30xWHG。客户手中实现的记录是196Gb（R10.4.1，今年LC23上提到），ONT内部通过在开发的快速马达蛋白声称已经实现了>350Gb的最大产出。

如果每个流通池产量达到400Gb，ONT有可能实现200美元的长读长基因组。那会是在什么时候？

看来，“暗黑”只是个开胃小菜，这还远远不够，是需要系统地去探索一下还有哪些因素可能影响测序运行的质量、产量和持续时间。

想必这些应该都已经在ONT的日程上了。