刘博谈 | 聊一聊如何选择质谱数据的显示格式

大家好，我是刘博，在上一篇文章当中，我和大家介绍了分子、质量测量和质谱图，在今天这篇文章当中，就给大家介绍一下如何选择质谱数据的显示格式。

测量质谱和/或显示结果的最佳方式是什么？答案取决于为光谱计划的应用。如果临床分析不需要超过单位质量的高分辨率（质量分离），也不需要显示各个峰的形状，那么简单的每峰一点（向心）分析和显示就足够了。然而，有许多质谱学家选择以「连续模式」测量他们的数据，即以1/10质量单位（或其他小数）获取数据，然后通过曲线拟合和曲线下面积计算进行处理。这种方法可以为获得的数据产生更准确的质量值，但与简单的每质量点的方法相比，可能需要更多的采集时间，并需要更多的计算机存储空间。

还值得注意的是，质谱的不同呈现方式与归一化有关。许多实验室的习惯做法是将每个光谱归一到基础（最强）峰。这可能会让刚接触这门技术的人感到困惑，所以建议在从数据中得出任何推论之前，要认识到归一化的条件。图1显示了两个质谱的比较，这两个质谱已被（A）归一化为每个显示的基峰（上层，m/z 222，5.0e6计数，下层，m/z 227，1.0e6计数），以及（B）归一化为上层检测组合的基峰（m/z 222，5.0e6计数）。在（A）和（B）中，上面的光谱和下面的光谱都是相同的数据。在（B）中更明显的是，受影响的痕迹显示在上层检测组合。很明显，如果要得出正确的推论，必须很好地理解数据的表述。

图1 | 质谱的比较

（A）每个光谱都被归一化为每个光谱中最强烈的峰；上m/z 222 5.0e6 counts；下m/z 227 1.0e6 counts。

（B）两个光谱都被归一化为上图中最强烈的峰的强度-m/z 222 5.0e6 counts。

（A）和（B）中的数据完全相同，但外观有明显的变化，在（B）中直接比较要简单得多。