事先声明：没收包括但不限于Illumina/MGI/Element/Ultima/Singular/Pacbio/ONT/真迈/铭毅智造/赛纳中的任何一家或几家的”黑钱“，俺是干净的。
美国时间2022年9月29日，全球首屈一指的基因测序仪制造商Illumina（因美纳）发布了今年的新品-NovaSeq X测序平台。 包含全新的化学、光学、BioIT升级，稍后咱们一一盘点。 不出意外，官方公众号一大早起来同步了这个消息（受苦了，Illumina市场部的朋友），并迅速点燃了话题，在圈内开始传播。
对，也不全对，至少划了Illumina自己的时代，别的就不一定了。 废话不多说，咱们逐一拆解这个新测序平台各个特性。 先来整体看一下几个表，让大家有个直观了解。 基础指标
产能指标
质量指标
全新的Chemistry X测序化学系统（但改了名）
早在今年的JP Morgan大会上（注1），Illumina就公布了相关的数据。
其核心是人工修饰碱基（X-NUCLEOTIDES）和高效的工程酶（X-POLYMERASE）。 碱基方面，使用了全新的终止子（X-BLOCK）、全新的连接子（X-LINKER）和全新的发光基团（X-DYES）。 带来的优点主要是3点：
工程酶方面，主要是2个改善：
如今，这套测序化学系统终于是用在了新的测序仪上。
根据Illumina官方的说法，是带来了2倍速的测序时间提升和3倍的准确度提升。 哦，对了，改名了，叫XLEAP-SBS。 实话实说，按照PE150的场景下，最大通量芯片（25B），Illumina这个说法有待商榷。
在25B芯片上以PE150运行，时间大约为48小时，这甚至比NovaSeq 6000还慢了4小时，更不用说跟MGI-T7的30小时去打了。 所以，在这个肿瘤检测领域，大家选1.5B和10B这两张芯片得了，在此情况下MGI优势不再，压力来到华大智造小伙伴这边。 另外再说准确性，Q30比NovaSeq 6000官宣的≥75%好多了，然而这个3X的accuracy咋就变成≥85%的Q30了？ 我还以为要奔Q50去了，吊打SBB的Q40…
甚至对比咱们刚开始的那第三张图，是不是Illumina宣传口的小伙伴喝多了？那NovaSeq X不是跟NovaSeq 6000一样的么？ 个人是有点失望的。 所以，我说，这样的NovaSeq X还划不了时代。
光学/表面化学
NovaSeq X的芯片拥有8条Lane，据说芯片密度又进行了提升。 这样就能够在更短的时间完成芯片的扫描。 当然，与之对应的就是更强大的激光系统和成像系统。 NovaSeq X配备了3种不同波长的激光系统，分别是532nm（4.5瓦）/457nm（6瓦）/655nm。 其中655nm用来对焦定位。 这与NextSeq 1000/2000的449 nm, 523 nm, 820nm相类似，而与NovaSeq 6000的532 nm,660 nm, 780 nm, 790 nm差距较大。
软解锁，异步上机
看到这里（注2），我感觉MGI的花活被学走了。 NovaSeq X Plus支持双flow cell，Independent flow cell operation，眼熟么？ 有没有华大智造的异步测序模式既视感？
不过目前这货应该是不支持“异步“测序模式（也就是说FC-A FC-B运行互不干扰），根据其他网站的介绍，目前仅支持”错开“开始时间（注5）。 这特妹的是啥意思？也只能叫异步上机了。 华大智造这个全异步测序申请专利没？赶紧的啊。 他要敢用就告他（拱火）。 不过，神奇的是NovaSeq X，单FC，但是，人家能升级到plus。 就像你的Iphone 64Gb换个芯片就能升级到1Tb一样。 这花活，建议MGI学习下，咱直接起个名叫modularized unit of sequencing technology，简称MUST，多高大上。 各位股东见证下，如果哪家公司叫这个名让他给我打下命名费。
BioIT升级
这个感知可能不明显，其实相比于其5倍的无损数据压缩（且不说压缩了个啥，fastq还是bam？），之前在JPM上的分析部分才是真正的大头。
我在之前说过（戳这里），Illumina的野心远远不止于测序仪，用我的建库、捕获、测序试剂，用我的测序仪，用我的分析设备和软件。 在BioIT上的策略就是通过机载的DRAGEN系统，让客户习惯使用，逐渐离不开。 怎么样？以后还要离开我么？
（图来自注3） 当然，这种方式也是有风险的，比如之前Illumina LRM漏洞事件（戳这里）。 对吧朋友，你也不想要这样的。
另外一个需要关注的点是，Illumina新测序仪已经抛弃了NovaSeq 6000 的Intel CPU，全面拥抱AMD。 AMD，yes!
其中，控制系统用的是AMD嵌入式Ryzen系列，基于14nm制程，4核心8线程。配备2X16=32GB的DDR4内存和480GB的固态硬盘，运行Oracle 8 Linux操作系统。 计算系统使用的是AMD 定制的EPYC 7552处理器，基于7nm制程，48核心96线程。配备8*64GB+8*128GB=1536GB（1.5TB）的DDR4内存，480GB固态硬盘（操作系统）+5*12.8TB（64TB）企业级固态硬盘，同样运行Oracle 8 Linux操作系统。 加上测序仪自带的4K显示屏，咱把这CPU/内存/硬盘拆下来玩扫雷速度一定很快。
敬请期待，改名先
顺带提一嘴长度长。
新CEO热衷于改名，之前的Infinity长读长产品被改成Complete Long-Reads。 在这里，我建议MGI法务部立即发律师函，毕竟Complete让人想起Complete Genomics，让消费者容易产生误解。 玩意这玩意不好使，锅岂不是我的了？
啊，对了，之前说是2022H2的early access，现在成了2023 出产品，非常有节奏。 至于最长30kb，一般6-7kb的读长咱们关心么？ 至少我不关心。
对我们来说，一个值得注意的点是，Illumina计划在2024年向NextSeq 1000/2000体系提供基于XLEAP-SBS的试剂。 压力再次给到华大智造的小伙伴们。 不过好消息是现有的NovaSeq 6000系列是不能用的，原因可能是我之前提到的光学系统的不兼容。
另外一个需要注意的点是，NovaSeq X先卖的是Plus，随后才是基础版，厉害了。
环保达人
一个重头戏是这是Illumina最环保的升级。 得益于XLEAP-SBS化学系统的进步，其相应试剂更加抗造（温度敏感性降低），运输已经可以免干冰运输。 据说节省了一年500吨的干冰（注4），好嘛，用也是你不用也是你。 加上使用环保可回收材料和降低部件尺寸，那是环保+环保，双环了。
这带来的改善也是很明显的。 首先，运输成本大幅度降低，毕竟不用干冰了； 其次，压缩存储成本，不用买那么多冰箱了； 当然，节省的成本会不会完全让给客户那就不知道了。
价格
很不幸，没人邀请我去美国参加Illumina的发布会，只能参考一下其他新闻的报道。 那么这么强大的测序仪多少钱呢？
哇塞简直太超值了，也就一套房子的钱就能买一台全球领先一段时间的NovaSeq X Plus这也太超值了吧。 一个Gb的成本能降到2美元，朋友们，测起来。 哇塞，华大智造9.99人民币/Gb哭晕倒在厕所了。
总结
让我们总体来看一下，只是我个人的看法啊，我也没收其他测序仪厂商的黑钱（没人给）。
算算时间，华大智造也应该有对标产品吧，仅仅个人推测哈。 折腾完G99的MGI会不会出个T20之类的，这不好说。 其实吧，最大的压力应该是给到了Ultima/Element/Singular这样的新兴测序仪公司，毕竟他们不像华大智造，还有自己的现金流和历史沉淀。 对吧？ |
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