文献速读|mNGS对于皮肤及软组织感染的应用价值

皮肤和软组织感染是一种最常见的感染性疾病，皮肤和软组织感染涉及到不同临床表现、病因和严重程度，病情可以是轻度的也可能严重威胁生命。其发病率约为尿路感染的2倍，肺炎的10倍。鉴于皮肤和软组织感染中病原体的多样性，临床医生倾向于选择广谱抗生素作经验性治疗，这可能会增加耐药菌的患病率,培养结果对于抗生素的选择至关重要,然而培养的阳性率低、灵敏度差，导至医师无法获得部分患者的病原学证据，因此很多快速和敏感的微生物检测技术应运而生，如基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)、聚合酶链反应、靶向基因测序等等。mNGS是一种病原体诊断的新工具，曾在2012年被《Nature》誉为革命性的病原学诊断工具，它使我们能够全面检测病原体，并有效的应对各种感染性疾病的挑战。

近日，复旦大学附属中山医院胡必杰教授团队发表了一篇关于mNGS对皮肤及软组织感染的诊断价值的前瞻性研究，研究结果表明：mNGS是皮肤及软组织感染极具前景的病原学诊断工具，特别是在诊断病毒、厌氧菌和混合病原体感染方面。此外，mNGS可以用于指导抗生素治疗的策略，并有益于临床结果。

研究选取了从2017年4月1日至2019年12月31日，共96例皮肤及软组织感染病例。采集感染部位的样本：组织样本、脓液、拭子和/或组织液，比较mNGS和培养检出阳性率和灵敏度，同时评估mNGS对于抗生素治疗策略制定的价值。

图1 患者招募流程

本研究的主要发现是：与培养相比，mNGS在以下方面有更好的检测：

(1)鉴定出比培养多两倍的病原体，特别是检测厌氧菌、病毒、结核分枝杆菌和非结核分枝杆菌；

(2)检测病毒和稀有病原体的能力；

(3)在单个样本中识别多种病原体。

此外，mNGS阳性结果显著有助于靶向抗生素治疗，当培养结果为阴性时，mNGS可能会改善预后。