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3年磨砺:高度成熟的肿瘤自动化建库系统MGISP-100

2019-12-21| 编辑: 小桔灯网| 查看: 8541| 评论: 0|来源: MGI华大智造

摘要: 随着肿瘤基因检测的临床需求不断增长,开展院内检测模式逐渐成为高通量测序应用的主流趋势。但在临床落地的过程中,测序文库制备流程的复杂性和稳定性却成为医院开展本地检测所面临的现实挑战。现实挑战01医生工作、 ...

随着肿瘤基因检测的临床需求不断增长,开展院内检测模式逐渐成为高通量测序应用的主流趋势。但在临床落地的过程中,测序文库制备流程的复杂性和稳定性却成为医院开展本地检测所面临的现实挑战。


现实挑战

01


医生工作、手工操作

影响建库效率和稳定性


一名检验科医生,假设从上午8点到下午18点都在进行手工建库,而且工作中需要全神贯注,否则容易建库失败。


(以常规建库流程为例,杂交捕获类流程时间更长)

02

实验室建设难


常规的建库实验室至少需要4间实验室以上,且有严格的建设要求,常规通常医院达不到该要求。



解决问题



如何解决这些现实的问题,推动高通量测序在医院端落地?2017年,华大智造率先行动,在业内给出了完整的解决方案,并在两年的时间内进行深度开发(包括肿瘤应用专项开发、平台通用性扩展),最终为院端应用提供了一款高度成熟、充分验证的可用于肿瘤检测的自动化建库系统。


2017年:针对院端落地需求开发的

MGISP-100正式发布


在医院部署的自动化建库设备,需要能一次处理8-16个样本、体积要缩小到能在桌面放置,手动操作要在10分钟以内完成。华大智造从医院落地的需求出发,经过2年研发和1次产品迭代,在第12届国际基因组大会(ICG-12)上发布了MGISP-100。


 2018年:针对肿瘤应用开展专项研发,

基于杂交捕获技术的肿瘤检测试剂盒完成验证


在肿瘤的杂交捕获还是基本靠手工完成建库的现状下,MGISP-100联合华大股份,对当前肿瘤领域最为热门的杂交捕获技术,给出了自动化的建库解决方案。实现从提取、文库构建、杂交捕获、DNB制备全流程自动化,最大限度减少手工时间。



基于MGISP-100的“华翡冉肺癌检测试剂盒”的支持100ng FFPE样本起始,可检测低至1%的频率突变;且建库成功率可达到99%以上


2019年:扩展平台通用性,第三方

多重PCR靶向试剂盒


MGISP-100能否给市场带来更多惊喜?2019年,大智造与第三方肿瘤检测试剂盒厂商Paragon Genomics、Pillar Bioscience等合,开发基于MGISP-100多重PCR靶向技术的肿瘤检测,进一步扩大了应用范围。


以Paragon试剂盒为例的分析流程和性能展示


目前,MGISP-100已经是一款高度成熟、充分验证的可用于肿瘤检测的自动化建库系统,拥有多个重要优势

1. 领先行业2年发布

2. 应用开发:全面适配杂交捕获类及多重PCR技术

3. 全球首家获得注册证:2019年2月NMPA认证

4. 实际临床应用:2019年入院,已在院端广泛使用





2020年:验证更多的可能性,开启多方合作新时代


2020年,华大智造将与更多第三方试剂盒厂商合作,开发包括其他杂交捕获方式的多种类型试剂盒;将进一步扩展适配性能,使MGISP-100系统适配赛默飞等更多测序平台。同时与更多的肿瘤领域企业建立合作,共同推动肿瘤检测在院端的落地和应用。

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