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华大基因CEO尹烨:如果生命也能计量,治愈疾病是否就像解方程一样简单?

2021-6-1 11:19| 编辑: 归去来兮| 查看: 2502| 评论: 0|来源: 尹哥聊基因

摘要: 2021年5月20日,在深圳市市场监管局组织召开深圳医疗健康产业计量论坛上,华大基因CEO尹烨作为专家出席论坛,并作主旨演讲。以下是讲话内容:拿到这个演讲题目的时候,我就在琢磨,该怎么诠释这个主题。为了让大家更 ...







































2021年5月20日,在深圳市市场监管局组织召开深圳医疗健康产业计量论坛上,华大基因CEO尹烨作为专家出席论坛,并作主旨演讲。以下是讲话内容:



拿到这个演讲题目的时候,我就在琢磨,该怎么诠释这个主题。为了让大家更好地理解,我先从一个骗局说起。


大部分人应该都知道,美国加州一家非常有名的血液检测公司Theranos,号称用1滴血,4个小时,可以查240多项检测。当时Theranos得到了诸多硅谷和政界大佬的“背书”。


Theranos的著名广告图

但这个故事从一开始,我就不信。


为什么?


这是一个特别基本的问题。假如有个100立方米的池塘,里面有10条鱼,假设鱼均匀分布,请问至少要捞多少水才能确保捕到一条鱼?


答案是,10立方米。这是个概率问题。


我们再来看看Theranos的血检法。就拿丙肝病毒(HCV)来说,它的最低检出限是100copies/mL,也就是说每10μL的血必须要有1个HCV分子才可能被检出。而1滴血是50μL,要分成至少10个检测通道,每个通道只有5μL的血,从概率来说能检出HCV的可能性更是微乎其微。

对于类似的骗局,如果物理上都不对,就别在生物领域装神弄鬼了

所以计量其实就是运用最简单的道理。从某种程度来讲,非常多的高科技,必须要经过理化乃至数学的检验。

为什么Theranos能在美国走这么远?这有点像第一类永动机,过于理想的科技蒙蔽了相当数量精英的慧眼。实际上只要回到计量本质,用小学数学就能识破这是骗局。所以,以后再看见一些特别颠覆性的高科技,大家心里面可以稍微先打一个问号。

新冠也一样。去年华大的新冠检测试剂盒在1月24号就拿证了,目前已经推广至190多个国家。回想去年,我们被问的最多的问题是:美国出了新的检测技术,30分钟出结果。还没等我回答完,又来一个20分钟出结果的产品,接着就是10分钟、5分钟,最后以色列说2分钟就能出结果。后面英国还说能通过狗的嗅觉,来判断一个人有没有得新冠。

我只反问了一句话:这么多这么牛的技术,为什么不在中国上市呢?

答案很简单,因为都过不了中检院国家标准品

中国中检院基于荧光定量PCR的检测至少要过500copies/mL的最低检出限。而美国的许多快检产品,最低检出限在2000~4000copies/mL。这些快检产品可以测流感,因为流感病毒感染上呼吸道,通常有几千上万个拷贝的病毒。但是新冠病毒感染的是下呼吸道,在环状软骨下取样,极其考验PCR的极限。许多“无症状感染者”就在一两百个拷贝。这就是为什么许多人在海外是阴性,到国内就“复阳”了,实际上这是在于中国的检测试剂盒灵敏度高

所以大家要明白,中国的检测标准,是全世界最严格的。中国新冠检测试剂盒的质量,实际上是全世界最好的。

在去年,某国说华大的新冠检测试剂盒出现“假阳性”。他们的报告是这么写的,说华大的试剂盒居然连只有轻微症状的人都检出来了。这怎么是“假阳性”呢?这分明是“真阳性”。

所以这是一件非常有意思的事情。当我们评价一件产品好不好的时候,一定要先明确标准。俗话说“离开剂量谈毒性就是耍流氓”,那么我可以说“离开最低检测线说检测时间,是不公平的。”所以,生命科学的很多问题,都需要我们用更多次的重复测量,来找到真相。

再跟大家讲个故事,这是最近的一个新闻:某地“患狂犬病”女孩抢救两月后过世,疑似“病源犬”经确认无狂犬病毒

这位患者究竟有没有感染狂犬病毒呢?相比很多人心里都有疑问。

新闻里说,有三家公司用测序或PCR的方法都没找到狂犬病毒,最后是华大的医检所检测出有狂犬病毒。于是这件事就变成了医疗纠纷。

到底有没有狂犬病毒?我们必须用数字说话。

最终我们证明,不是没有狂犬病毒,而是测量不够。我们测了1亿次才找到了真凶。因为狂犬病毒的感染载量非常低,其他三家公司的检测量大多在500万~2000万次,而华大直接测了1亿次,并把病毒的基因组组装出来了。所以,许多看不见的问题其实是在于我们做的次数不够多。

为什么日内瓦的正负对撞机经过几十年才发现双电荷离子呢?因为这是个概率问题。

但是生命和理化的计量还是有所不同,生命是涌现的产物,很多时候不能用简单的质量和数字去说明,这也是我们生命科学从业者经常会发表的感慨。

科学家可以测算出天体的运行轨迹,却无法说明两只蜣螂的生物行为。所以马丁·约翰·里斯说:即使是最小的昆虫也比恒星复杂的多

如果四维宇宙是正确的,我们只需要两个基本单位。

第一个基本单位就是“米”,将其定义为:1/299792458秒的时间间隔内,光在真空中行程的长度。有了长度单位,空间就能描绘出来了。

时间用“秒”定义:铯-133原子基态的两个超精细能级之间跃迁所对应的辐射的9,192,631,770个周期的持续时间。

我们用自然回答了人类的问题。当然,7个基本单位不一定都能用自然定义。比如,“千克”就是人为的定义。以上就是我们过去的理化计量。

但是,生命如何计量?

一个DNA,A、T、C、G四个字母,质量一样,顺序可以不一样。就像一个单词,字母顺序不一样会产生不一样的意思。所以我们内部也经常讨论,如果说我们过去用了大量的计量手段,测量、称量、绘量,到了DNA层面上、蛋白质层面上、代谢组层面上,要多元回归,这种跨组学的计量就是从译量到悟量的过程

译量是先把生命“翻译”出来,后面再说其代表的表型意义是什么。所以,生命领域的计量,维度要比理化计量要复杂得多。

举个例子,前不久在东莞的一个案例,患者求医许久,最后通过补充维生素B治愈了疾病。听起来非常简单的治疗方式,实际上背后的诊断过程用了基因测序技术。患者基因SLC52A2的变异,导至维生素B2代谢紊乱。生命如果是个语言,“得知序列”是一次测量,“找出变异”是一次译量,“对症下药”是悟量。这需要结合大量的基因遗传型和临床表型,最终展示成医生和患者都能看懂的高维度的结果。

从这方面来看,中国有相对更多的机会去发展这个领域,因为中国人群大、数据大,所以译量和悟量都会更为准确。既然生命是一种语言,那么生命的计量就一定要“有意义”,而非单一的数量。

在上个世纪80年代,生命中心法则的主要提出者之一讲了特别经典的话:科学的进步源于新技术、新发现、新想法的推动。按重要性来排序的话:新技术先于新发现;新发现先于新想法。

也就是说,生命科学依赖于技术进步,通过工具进步降低成本,进而获得更多的数据,从数据中又能看到新理论、新学科、新技术……

所以,今天的科学,今天的工程,今天的计量,在我们挑战天体物理、追寻量子科技的时候,它的排序必须是新技术、新工具、新发现,最后才是新想法。

用一个最简单的例子:为什么是LIGO证明了引力波?

因为装置足够大!

相当于,列文虎克用显微镜看见了微生物,有了电镜我们才看到了病毒。如果没有工具,一切都只能靠“猜”。

中国现在的一些源头创新,我们或许不能说出它的直接意义。就拿“中国天眼FAST”望远镜来说,许多人都提出疑问:“天眼”有意义么?

1969年,物理学家罗伯特·威尔逊就对粒子加速器资助向美国参议院作证时,被问到的问题是:粒子加速器是否有助于保护国家?

罗伯特·威尔逊说:没有任何直接帮助,除了它可以证明这个国家更值得保护。

同理,这就是“天眼”的意义,这就是大科学装置的意义。

中国从来不缺商业模式的创新,目前正在加强文化的创新,但是我们从骨子里还没有太多科技的创新。所以现在国家正在通过大科学装置去挑战认知的边界。

在过去的理化范围,在物质科学上,是一个跨尺度、跨时空的多模态的观察和测量。从最小的基本粒子一直到宇宙的网状结构,这是我们今天一直在讨论的内容。

在生命科学领域,我们现在讨论的是全生命周期的4D和数字化。生老病死、基因组、代谢组、蛋白质组、菌群组、表观遗传组……

于是我们需要工具的支撑。物理科学用多维度/多信使大科学工具与平台解决宇宙诞生以来百亿年的事。而生命科学则是通过测量、称量、绘量、译量和悟量把所获信息变成4D化的过程,从中得到更精准的数据为大家所用。

这些工具里,哪些是中国的?

元素周期表里,有多少是中国人的贡献?

答案是:两个——锌和砷。

我们再来看看生命周期表。生命周期表是已经被测序的高等动植物的基因组。中国的贡献占32%,高于美国的25%。其中华大占32%中的24%。我们有足够的数据,可以在生命科学领域跟全世界最先进的国家一较短长。

基因测序仪可以做到“译量”和“悟量”人的基因组序列。而目前只有两个国家、两家公司可以量产对一个人做全基因组测序的机器——美国的Illumina和中国的华大智造。

第一个人类基因组从1990年做到2003年,用了13年的时间,花了38亿美金。今天,500美金,一天的时间,在华大就可以测几千个基因组。这个定律的下降速度比摩尔定律还快。所以这就是整个生命科学产业里,我们能看得见的未来。

今天我们是怎么测序的呢?华大已基本实现全自动化,包括全自动的生物信息分析。这得益于中国制造的强大,得益于深圳产业配套的强大。相信中国人有本事做出全世界最好的机器。


所以,在生命世纪,华大的超级测序工厂对生命计量极其有意义。它是今天中国真正可以自主可控的、不被卡脖子的一套超级工程。

我也经常跟华大做计量的小伙伴们讲:计量人的未来是什么?

在这里不得不提到范尼瓦尔·布什。1945年,在二战胜利前夕,罗斯福让他写一份报告,这份报告就是《科学:无尽的前沿》。

拜登在上台后,这份报告再次引起热议。拜登请了一位基因组专家埃里克·兰德,重写这份报告。最近,美国参议院商务委员会审议通过《无尽前沿法案》,授权在五年内为美国基础和先进技术研究提供超过1100亿美元的资金支持,以便实现美国在相应技术领域的发展野心。该法案明确将中国视作劲敌与防范对象,并将出台严苛规定限制与中方有联系的科学家参与美国科研项目。其实这份法案是由《科学:无尽的前沿》派生出来的,也能看出美国对中国科学发展的忌惮。

我们暂且不论科技政策,就单说这一篇报告,它改变了美国的科技范式转向大科学工程。自此,曼哈顿计划和阿波罗登月计划相继实现,人类通过一个又一个大科学工程,完成了从微观粒子到银河系的测量。

所以,科学,无尽的前沿计量,永恒的根基

这就是我们所有计量人的未来。

生命世纪已到,让我们一起,为生命计量!

-END-


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