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18S 荧光原位杂交(FISH)实验总算是做出来了! ...
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18S 荧光原位杂交(FISH)实验总算是做出来了!
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发表于 2025-6-12 16:02
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之前一直想在Hela细胞里面用荧光原位杂交技术检测一下18S 的定位,也不知道是不是合成的RNA探针检测灵敏度不够,一直做的不太理想。近期换了个探针合成试剂盒-BIOG品牌的,加上实验室师兄的悉心指导,总算是做出来了!跟大家分享一下我的实验方法和试剂:
探针合成试剂盒:
BIOG Cy3标记RNA探针合成试剂盒
使用感受:合成效率和产量与同类试剂盒比的话要跟高,从检测结果看探针的灵敏度也很高
实验步骤:
一、样本处理
1、细胞培养:细胞培养至盖玻片上(使用多聚赖氨酸进行预处理),待细胞密度达到70-90%时,用PBS洗涤细胞2次,每次3分钟。
2、固定:加入
4%多聚甲醛固定液
室温固定10 min。
3、洗涤:去除固定液,用PBS(DNase/RNase free)室温摇床缓慢摇动洗涤2次,每次3 min。
二、通透
4、加入0.1% Triton X-100/PBS室温处理10min。
5、洗涤:弃去通透液,用PBS摇床洗涤2次,每次5分钟。
三、样本变性
6、以上期间,配制杂交反应液,将探针加入杂交缓冲液至最终浓度为1ng/μL 。
7、滴加30μL杂交液覆盖全部样本,盖膜后,放入湿盒,85℃避光孵育5分钟,立刻冰浴5分钟。
8、将湿盒放于55℃孵育过夜(12-20小时),注意避光。
四、杂交
五、洗脱
9、避光,将样本用55℃预热的50%甲酰胺/2×SSC洗1次,5 min。
10、避光,将样本在55℃预热的0.1% Tween 20/2×SSC洗涤1次,5min。
11、避光,将样本在55℃预热的1×SSC洗涤1次,5min。
六、细胞核染色
12、 滴加 200 µL DAPI工作液覆盖样本,避光染色5 min。
13、 用1× PBS洗2次,每次2 min,之后可以直接在荧光显微镜下拍照;也可以去除PBS,滴加10-30µL抗荧光淬灭封片液封片延长保存时间,显微镜下观察拍照。
实验结果:
图A. 使用BIOG cy3标记RNA探针合成试剂盒合成Cy3标记的18S RNA探针,采用荧光原位杂交(FISH)实验检测Hela细胞中18S rRNA的定位。
原文地址:https://zhuanlan.zhihu.com/p/1916515953673506902
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