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[分享] 在你科研过程中遇到过哪些惊艳的图片?

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发表于 2024-12-15 20:45 | 显示全部楼层 |阅读模式
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发表于 2024-12-15 20:45 | 显示全部楼层
内容相关:结构生物学-酶构象改变与底物结合机制-去泛素化酶
不仅有图片,还有视频呐~

一段小多肽loop的舞蹈
https://www.zhihu.com/video/1035213601308692480
如图所示,形象展示了去泛素化酶结合到多聚泛素链中两个泛素连接处的自调节机制和反应过程。
泛素:细胞内蛋白质的标志物,由一系列复杂过程被连接到蛋白质上,其中大部分被标记的蛋白质会被蛋白酶体降解。连接到蛋白质上的泛素还可以被继续泛素化形成复杂的泛素链,泛素与泛素之间有八种连接方式。
去泛素化:人体细胞内有一百多种去泛素化酶可以去除掉被泛素化的蛋白上的泛素,其去除方式主要是降解切断蛋白质上的泛素链。图中所示的是特异性降解泛素11位Lys赖氨酸与前一个泛素蛋白C端形成的肽键。

来啊快活啊~
https://www.zhihu.com/video/1035216125642088448
参考文献:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5295632/#SD1

  • Mevissen TET, Hospenthal MK, Geurink PP, et al. OTU Deubiquitinases Reveal Mechanisms of Linkage Specificity and Enable Ubiquitin Chain Restriction Analysis. Cell. 2013;154(1):169-184. doi:10.1016/j.cell.2013.05.046.
  • Mevissen TET, Kulathu Y, Mulder MPC, et al. Molecular basis of Lys11-polyubiquitin specificity in the deubiquitinase Cezanne. Nature. 2016;538(7625):402-405. doi:10.1038/nature19836.
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发表于 2024-12-15 20:45 | 显示全部楼层
谢邀~
好看的图片千篇一律,有趣的结果万里挑一
宏观生物到了分子这一层级大都会变的非常的“惊艳”,一是大家谁都没见过,二是这些分子级的小部件确实被设计的极为精妙,甚至超出了人类的水平。
比如,有这么一个部件,它是细菌感染真核生物细胞的强有力武器,分子生物上一般称之为Type III  Secretion (三型分泌器),画出来大概是下图的样子。
关于植物与病菌之间如何侵染和反侵染,可参考浅谈植物免疫——植物与病菌的战争



TypeIII secretion示意图

由于细菌尺寸太大,不能直接通过真核生物的细胞膜(植物细胞还有细胞壁),细菌就通过这样的装置刺穿细胞膜,将抗原释放到细胞内部,达到侵染的目的。



左图蓝色为细菌,细菌表明针状物就是Type III secretion。右图是secretion的放大图,大致分为三个部分,底座,基体,针。

图中标注的尺寸,都是纳米级的,只有通过电子显微镜才能隐隐约约看到它的实体。如果把Basal body 放大,会看到这样的——一个复杂的齿轮咬合结构,是不是像极了人类工业文明的产物?



TypeIII 核心 组件

近期,科学家通过低温电子显微镜,第一次观察到细菌如何通过这个装置感染宿主细胞



图中红色框框里的就是Type III secretion,下面一列是放大后的图


第一次亲密接触:细菌侵染宿主
https://www.zhihu.com/video/1034019696961409024
视频中也演示了其工作原理:分泌器的内部是中空的,底座部分是由许多蛋白组成的复合体,类似于一个微小马达,可以驱动分泌器的转动,带动针刺穿宿主细胞的细胞膜。刺穿以后,细菌就将准备好的抗原物质(一般是蛋白或者小分子)通过中空的管道注射进宿主细胞内。当然其中是否还有更多深奥的原理,以目前的科技手段,还不得而知。
很难想象自然界中被人类划分到最低级生命形态的生物,会具有如此精密高级的纳米级武器。
而这样的精密武器,细菌界有一套,至于具体的工作原理,还有哪些未知的,就需要去探索了




<hr/>说完细菌,再来说说植物。
这张是植物胚的,植物学家把每个阶段都通过显微镜呈现出来。
并用计算机模拟出胚的发育过程。




拟南芥的花芽和叶芽——以后将发育成花和叶的一团细胞





微观结构



荧光显示蛋白亚细胞定位



植物组织染色



GUS染色(提夫尼蓝?)

参考文献:
Visualization of the type III secretion mediated Salmonella–host cell interface using cryo-electron tomography
The structural biology of type IV secretion systems
Bacterial Secretion Systems – An overview
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发表于 2024-12-15 20:46 | 显示全部楼层
在实验心理学课上第一次看到这个烟花图就被惊艳了


猜猜这是什么?
在解密之前,先介绍一下这个图是怎么产生的吧~
这是波士顿大学医学院生物医学成像中心的Andy Ellison利用一台磁共振成像仪(MRI)扫描某种蔬菜产生的。MRI通常用于扫描大脑以观察大脑的结构。当然,Andy Ellison直接在电脑上获得的并非这张gif动图,而是一张张不同垂直距离下该蔬菜的横截面(就像一个xyz三维坐标系,每一张图是x为某值时,yz轴平面的投影图),接下来再将不同x坐标的图合成制作出来了这样漂亮的烟花动图。换句话说,这是该蔬菜从下到上横截面的三维模型动图。
所以这个到底是什么呢……




我只是个菜花,我没有脑子

就是菜花!
当然,Andy Ellison扫描的不止一个菜花,而是放了一大堆稀奇古怪的水果蔬菜进去扫描(用上千万的仪器来扫描蔬菜玩真的是很皮了,捂脸.jpg)日常再普通不过的东西放到MRI里,都是一个新的模样。
感兴趣接着来猜猜吧~



天上的星星,我摘给你



杨桃



不过是个穷苦书生,无法送99朵玫瑰给你,特意为你扫的抱子甘蓝,还喜欢吗?



抱子甘蓝



爱我你怕了吗



刺角瓜



我愿意一层一层一层一层地拨开我的心~



洋葱



妈妈,那不会是 宇宙黑洞吧?!



竹笋

哦不,是这个图


最后一个留个小悬念,猜猜是啥呀~



MRI可以说提供了一个全新的视角去认识我们熟悉的事物(食物),有没有觉得很神奇呢~

参考文献
Insides Insides(2014).Retrieved October 11,2013,from https://insideinsides.blogspot.com/

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发表于 2024-12-15 20:47 | 显示全部楼层
以前学院里也会组织科研美图大赛
很多同学都在培养基上用细菌真菌作画
看到的往往都很稀松平常
比如这种


这种


还有这种


一般般嘛,我也能画

直到我有一天上网冲浪看到了这个图



冬春之战(The Battle of Winter and Spring)

“冬春之战”(The Battle of Winter and Spring),美国微生物学会2018年第四届培养皿绘画大赛的冠军作品,由格鲁吉亚农业大学学生Ana Tsitsishvili创作。

给跪了好吧
这里面用到了多少菌种我们就不说了
单是那种细微地把菌落错落有致地划上去还不互相干扰就很牛逼了,“白色的“冬天”由葡萄球菌与蕈状芽孢杆菌组成,它无法突破培养皿的中线,这是因为另一侧的培养基含有抑制这些细菌生长的抗生素。春天的一侧含有微球菌以及红酵母菌,它们对培养基中的抗生素具有抗性。”
还有背景的烟雾,非常到位
真想看看这个培养皿长满之后是什么样子
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发表于 2024-12-15 20:47 | 显示全部楼层

曾经待的组里做电池材料的,需要用电镜表征材料形貌,上图是组里一位师兄做层状材料MoS2做出的一朵纳米花,还有露珠在上面。
纳米花有很多paper都报道(还上过nature nanotechnology的封面)google nano flower也能看到,不过这朵花是无心插柳,因为他应该做成大片层状的,没想到团聚在一起成一朵花了,估计是条件没控制好。当时看到还是挺惊艳的,镜头移来移去发现结构一团糟,突然出现在镜头里一朵花,挺治愈的
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