流式细胞仪所产生的常见图

风云

1 直方图(Histogram):
X轴:测量的参数,如荧光强度、细胞大小等。
Y轴:细胞计数或百分比。
展现的信息:单个参数的细胞分布情况,反映细胞群体的均一性和表达水平。
举例:测量细胞表面标志物CD4的表达水平。直方图显示了细胞群体中CD4表达强度的分布,可以根据图形判断细胞群体的均一性和CD4阳性细胞的比例。
2 点图(Dot Plot):
X轴和Y轴:分别表示两个不同的测量参数,如前向散射(FSC)和侧向散射(SSC)。
展现的信息:两个参数之间的关系,可以识别细胞亚群和评估不同细胞群体之间的相关性。
举例:通过FSC和SSC的点图,可以区分淋巴细胞、单核细胞和粒细胞等不同的细胞群体。每个细胞群体在图中呈现出特定的分布模式。
3 密度图(Density Plot):
X轴和Y轴:与点图相同,表示两个不同的测量参数。
展现的信息:细胞密度的分布情况,有助于识别高密度的细胞群体和潜在的稀有细胞群体。
举例:在分析骨髓样本时,通过CD45和侧向散射(SSC)的密度图,可以鉴别正常造血细胞和白血病细胞。白血病细胞通常会形成一个高密度的异常群体。
4 等高线图(Contour Plot):
X轴和Y轴:与点图相同,表示两个不同的测量参数。
展现的信息:细胞群体的结构和分布,等高线围绕高密度区域,有助于可视化细胞亚群。
举例:在分析T细胞亚群时,通过CD4和CD8的等高线图,可以清晰地识别CD4+T细胞、CD8+T细胞和双阴性T细胞等亚群。
5 散点图矩阵(Scatter Plot Matrix):
X轴和Y轴:每个子图表示两个不同的测量参数。
展现的信息:多个参数之间的成对关系,有助于快速识别参数之间的相关性和细胞亚群。
举例:在分析细胞周期时,通过DNA含量、细胞大小和细胞增殖标记物Ki-67的散点图矩阵,可以全面评估细胞周期的分布和各亚群之间的关系。
6 t-SNE图(t-SNE Plot):
X轴和Y轴:表示降维后的两个维度。
展现的信息:高维数据在二维空间中的分布,有助于可视化和识别高维数据中的细胞亚群。
举例:在分析单细胞RNA测序数据时,通过t-SNE图可以将高维的基因表达数据降维为二维空间,从而识别不同的细胞类型和亚群。
7 SPADE图(Spanning-tree Progression Analysis of Density-normalized Events):
图中的节点:表示细胞群体,节点的大小表示细胞数量,颜色表示特定标记物的表达水平。
展现的信息:细胞发育的进程和细胞群体之间的层次关系。
举例:在分析造血干细胞分化时,SPADE图可以展示从造血干细胞到成熟血细胞的分化轨迹,并揭示不同分化阶段的细胞群体特征。

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