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[分享] qPCR实验复孔重复性差?分析与建议

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发表于 2024-9-6 11:20 | 显示全部楼层 |阅读模式

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qPCR实验中通常会遇到复孔间重复性差的情况,一般有以下两种:
     一、CT值很大,如CT≥30,重复性差属于正常现象。该现象符合泊松分布,即在有效模板量很少的情况下,模板与引物的碰撞存在随机性,直接导至复孔间的CT值差异较大。解决方法为如果融解曲线没有杂峰,无模板阴性对照同目的基因的△CT值为3 or 5以上,那CT值为准确的,可多设置几个复孔,选择重复性好的CT值参与计算。     二、CT<30,重复性较差。这种情况一般同操作有关。可从以下几个方面进行排查:     1 加样准确度:避免小体积加样,减少加样误差。可以将引物、SYBR Green Mix、ddH2O配置成混合体系,并且增加模板的稀释梯度,大体积加样。如:原液cDNA添加1μl,可以更改为原液cDNA稀释5倍,添加5μl,使用ddH2O补齐体系至20μl即可。     2 SYBR Green Mix、配置的混合体系需要混合均匀。从-20℃冰箱拿出的试剂需要完全融化并上下颠倒彻底混匀;配置体系时,将混在一起的Mix用移液器吹打混匀。     3 移液器吸取液体的准确度:移液器量程定期校准,校准周期为1年。购买与移液器配套的枪头,若枪头与移液器不匹配,在吸取液体时易出现漏气的现象,导至吸取量程不准确。在吸取相同量程的液体体积时,注意观察每次吸取液体在枪头内的液面高度是否一致。     4 定期校准qPCR仪:一般qPCR仪校准周期为一年。
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