距离中国生物信息中心还有多远

千姿百态

10月1日，由于美国民主、共和两党尚未解决新财年的政府预算分歧，联邦政府的非核心部门被迫关门。其中就包括医学、药学及生命科学从业者及研究者依赖度甚高的NCBI（美国国立生物技术信息中心）网站。

NCBI是由美国参议员Claude Pepper于上世纪80年代后期发起成立。旨在发展新的信息学技术来帮助理解那些控制健康和疾病的基本分子和遗传过程。此外，NCBI还负责开发自动化系统用于存储、分析关于分子生物学、生物化学、遗传学等方面知识信息；通过研究和医学团体所提供的软件和数据库使得其得以利用；收集国内外生物技术信息资源；开展基于计算机信息处理过程高级方法研究，用于分析生物大分子的结构和功能。

NCBI数据暂停更新，对于世界各地的研究者的影响不言而喻。世界各地的研究者不仅向NCBI提交自己的研究数据，同时还利用其旗下纷繁复杂而又功能强大的数据库帮助推进自己的研究。这其中对中国研究者的影响更甚。因为中国目前并没有自主的生物信息中心，使得NCBI数据暂停更新直接影响到中国研究者的工作。

随着高通量技术的发展，生命科学、生物医药的研究已经全面进入了大数据时代，生物信息已成为破译大数据必不可少的工具。中国没有自己的生物信息中心，一直面临着“出口转内销”的模式，科研数据不得不提交到国外数据库，需要数据时又不得不从国外数据库下载；网络技术的限制与瓶颈给科研人员带来了诸多烦恼。尽管中国是数据产出大国，每年向国外数据库递交了大量数据，但在他们眼中，中国一直是作为用户在使用他们免费提供的资源，而未做出任何贡献。这就导致中国在国际上彻底尚失了话语权并造成了负面影响。

庆幸的是，国内已有科研精英意识到建立生物信息数据库的重要性，并且开始正在筹划成立中国自主的生物信息学中心。该计划由陈润生等9位院士联名向院士局提议，现有12个国内优势的生命科学、生物医药、计算科学、生物信息等单位参与，其中包括北京大学生物信息学中心、中科院基因组学中心、北京蛋白质组学中心、太仓生物信息研究所等机构。项目正处于全面调研阶段，预计今年年底完成调研报告的撰写，争取纳入国家的“十三五”规划。

值得一提的是，在NCBI暂停更新之后，太仓生物信息研究所凭借自身技术优势为中国的生命科学研究发挥着积极的作用。

太仓生物信息研究所（TILSI）是一个学术研究机构、非盈利性的事业单位，致力于建设国内外生物数据、分析工具和科学文献资源的整合平台，为支持具有重大战略意义的国家级生命科学研究做出重要贡献，推动中国生命科学、生物医药以及生物信息学研究的发展。

目前TILSI已整合的6种数据类型——基因组、核酸、蛋白质、结构、疾病、分子间相互作用均为生命科学、生物医药研究领域常用的数据库，在NCBI暂停工作期间尚无需要更新的内容。6种类型的11个数据库中仅有Refseq参考序列数据库的数据来源于NCBI，其他数据主要来自EBI，EBI不会因为NCBI暂停更新而停止更新，所以TILSI的数据资源不会受到影响，用户可放心使用。

另外TILSI自主研发了国内首个生命科学领域的全局搜索引擎bioso!，支持多种数据类型，方便科研工作者在海量的信息中整合出相关的数据。作为数据平台的入口，bioso!为用户提供了跨数据库的“一站式”检索与“百科全书”式的展示。百科全书分为五个章节，已对外开放三个章节-基因与基因组，基因型与表现型，相互作用与网络；剩余两个章节处于准备阶段。

早日成立中国自主的生物信息学中心，从而整合国内现有的优质资源，开发出中国特色的数据库与服务，更好地为中国用户提供科研支撑。并且通过加入国际联盟，参与国际合作，才能提升中国在国际上的地位和话语权。