基因检测捕获探针

yijuanyun

xGen®Lockdown® Probes以其在实践中高度的灵活性和捕获效率著称。

xGen® ProbesPanel 系列产品是IDT 针对NGS检测设计的高质量，高灵敏度，高通量的基因捕获产品。xGen® ProbesPanel 可以从基因组里抓取科研工作者感兴趣的片段，高效覆盖SNPs，InDel 等突变位点，一个Panel里可以同时覆盖捕获多个基因，包含多达到上十万条探针。

▽ IDT xGen® probes end-to-end 的覆瓦状的设计思路

▽  xGen® Lockdown Panel 每一条探针都是利用Ultramer 技术合成

xGen®Lockdown® Probes因其灵活性，可以与多款产品搭配使用。

搭配一：与Swift Accel-NGS®2S Plus DNA Library Kit搭配，测序“无往不利”

xGen®Lockdown® Probes 与 Swift Accel-NGS® 2S Plus DNALibrary Kit 强强联合，可以针对感兴趣的序列进行捕获和测序，提高测序的效率。Accel-NGS®2S Plus 建库试剂盒，建库起始量低至10pg，适用于FFPE、cfDNA 样品，可以检测到0.5% 的突变。

百搭二：与竞品捕获Panel 搭配，“捕其之所不能”

IDT 的xGen® Lockdown Probe Panel 目前市场流通的竞品，主要有Agilent公司的SureSelect® 捕获试剂盒和 Roche 公司的 NimbleGen SeqCap捕获试剂盒。

百搭三：与同系列 Capture Panel 搭配，探针增减 “随心所欲”

如果您定制的 xGen Lockdown Custom Panel有一些探针表现的不好，您可以用其互补的探针使改探针“沉默”。如下面的例子，原本7837个探针的 Panel，有10条捕获效果不好的探针，捕获区域与 Alu repeat 重合。重新spike-in 一些 Ultramer® Oligos 后，捕获结果的on-target percetage 指标大大提高。

百搭四：针对不同的捕获目标，xGen®Lockdown 提供“个性化定制”服务

除了4个Predesigned Panel，IDT的官网还提供在线的xGen® Lockdown DesignTool。网址如下 ，

https://sg.idtdna.com/site/order/ngs

您可以根据目标序列的Gene Symbol，Fasta，bed, NCBI Gene ID以及RefSeq transcript accession 文件来进行相关捕获探针的设计。

百搭五：“百搭”的 Universal xGen®Blocking Oligo

为了解决由adapters引起的“非特异性的捕获”，要利用Blocking Oligo “封闭”部分序列，提高捕获效率。

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好好学习一下