通过循环肿瘤DNA定量检测肺腺癌驱动基因EGFR突变

检验之星

目的
表皮生长因子（EGFR）突变检测是使用EGFR-TKI治疗肿瘤前的常规诊断。循环肿瘤DNA（ctDNA）是非侵袭性诊断中最有潜力的检测标本。我们通过BEAMing定量检测这些敏感和耐药性突变来评估ctDNA的实用性。
实验设计
筛选出23位经过EGFR-TKIs治疗后进展的肺癌患者和21位从未接受过EGFR-TKIs治疗的肺癌患者，检测这些患者的原发性肿瘤都具有敏感性突变。利用BEAMing技术在每位患者的血浆DNA中检测与原发性肿瘤一致的敏感突变以及定量检测T790M突变。
结果
44位中的32位患者的血浆DNA中检测出了敏感性突变（72.7%；95% 置信区间（CI），58.0%–83.6%）。23位接受过TKIs治疗的患者中有10位检测出了T790M（43.5%；95% CI，25.6%–53.4%），T790M在敏感突变中的比值范围为13.3%—94.0%。血浆DNA中等位基因突变的分布峰值区间在0.1%—1%。
结论
BEAMing的优点是它能够从敏感突变等位基因中定量少部分的T790M等位基因。BEAMing能够检测出癌细胞中T790M突变数的增加和减少，而不受正常细胞DNA的干扰，这使得它在监测疾病进展中十分有用。
研究结果
1.EGFR敏感性突变和耐药性突变等位基因频率
通过BEAMing检测44位患者检测血浆DNA中T790M突变和敏感突变。结果如表1所示，44位患者中的32位血浆DNA中检测出了敏感突变（72.7%; 95% CI, 58.0–83.6%），且第一组高于第二组（组 1, 82.6%; 组2, 61.9%），但并没有统计学差异（P = 0.18）。L858R/L861Q和19缺失的检出率是一致的。在第一组中检测出10位患者具有T790M突变（43.5%; 95% CI,25.6%–53.4%），T790M是导至TKIs耐药的的主要因素，BEAMing很有可能检测出了绝大多数的T790M突变。患者21和42仅出现了T790M突变。
表1 EGFR敏感与耐药突变的等位基因频率

2.通过EGFR突变检测定量血浆DNA中小部分的ctDNA
根据直方图统计，敏感性突变分布规律峰值范围为0.1%到1%，T790M突变频率更低。进而我们分析了得到的血浆DNA量与敏感突变DNA中推测出的ctDNA百分比的相关性，但却发现两者没有任何关系。可能因为一些样本得到大量血浆DNA但EGFR敏感突变并未被检测出。

图1 A：血浆DNA中敏感突变（白色柱子）和耐药突变（灰色柱子），横轴为突变频率，纵轴为患者数；B：获得的血浆DNA量（pg）和EGFR敏感突变分数，横轴是400μL血浆中DNA量，纵轴是EGFR敏感突变分数
信息来源：
Kazuya Taniguchi, JunjiUchida, Kazumi Nishino, et al. QuantitativeDetection of EGFR Mutations in Circulating Tumor DNA Derived from LungAdenocarcinomas. Clin Cancer Res; 17(24) December 15, 2011.

来源：靶向分子诊断