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[专家视角] 药明康德冀群升博士:全球首个整合的肿瘤模型在线数据库正式发布

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发表于 2015-6-9 20:14 | 显示全部楼层 |阅读模式

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5月29日,药明康德肿瘤事业部宣布其全新的第二代肿瘤模型在线数据库,全球首个肿瘤模型在线信息数据平台 "OncoWuXi" 已经正式启用。公司表示,随着全基因组测序技术的飞速发展,癌症治疗已经步入了精准医疗的时代。为了抓住这个机遇,公司建设了全新的肿瘤模型数据库: "OncoWuXi"。

OncoWuXi数据库包含了全面的肿瘤模型数据和详尽的基因分析数据,将每个肿瘤模型的临床样本基本信息,特征参数和建模验证数据,以及其相应的基因组分析数据整合在了一起,为癌症药物的开发提供了一个全新的平台。

用户在这个数据库中可以通过DNA全外显子序列,RNA序列,基因表达微芯片和拷贝数变化(CNV)等数据,搜索到携带临床相关肿瘤突变基因的PDX,CDX或者同源小鼠肿瘤模型。此外,包括肿瘤模型的生长曲线,组织病理和SoC验证数据在内的信息也同样可以查阅。




据了解,OncoWuXi数据库自正式对外发布起,浏览量持续飙升,申请注册的人数也远超预期。市场关注的热度,体现了目前用户对于相关数据库的巨大需求。那么,该平台是何时开始搭建的?有哪些特点和用途?对于用户的价值是什么?对药明康德的发展会有怎样的影响?生物探索记者带着这些问题第一时间采访了药明康德肿瘤事业部副总裁冀群升博士。以下是采访实录:

生物探索:OncoWuXi是从何时开始搭建的?搭建的初衷是什么?

冀群升:随着肿瘤基因研究和人类基因组测序技术的进步,癌症药物研发正经历着从分子靶向药物到精准药物的演变。肿瘤动物模型是癌症药物研发过程中不可缺少的临床前药效评价平台,同时,也是研发靶向药物和精准药物的一个瓶颈。能否选择到与肿瘤患者相对应的动物模型,往往决定着一个癌症新药研发项目的成败。因此,肿瘤模型数据库对于癌症药物的研发意义重大,科学家们可以通过数据库中的相关信息,选择特定的肿瘤动物模型进行药物的体内药效评估。

之前业界已有的肿瘤模型数据库,存在着各种不足之处,如肿瘤模型相关临床信息、建模验证数据或基因分析数据缺失,查阅不同模型数据需要频繁切换数据库,使用界面复杂难懂等。为了使药物研发工作者更便捷的获得肿瘤模型的全面信息,从而选择最精准的动物模型进行药效评估,我们于2014年年底成立项目组,筹划搭建全新的肿瘤模型数据库OncoWuXi。

生物探索:作为全球首个整合的肿瘤模型在线信息数据平台,OncoWuXi有哪些特点和用途?对于用户的价值是什么?

冀群升:作为全球首个整合的肿瘤模型在线信息数据平台,OncoWuXi汇集了与药物研发密切相关的肿瘤模型信息,并将其整合在同一个数据库中。目前,它包含了1100个肿瘤模型及其相应临床及诊断信息,500套整合的基因组学/转录组学解读数据,2500个肿瘤生长曲线,2500张组织病理学图片,120套标准治疗(SoC)的药物敏感性数据。此外,我们还根据目前与癌症最相关的320个热门基因为每个人源肿瘤模型做了预“诊断”。

将如此多的数据整合在一个数据库中,在癌症药物研发领域,应该是一个开创性的举措。这个数据库的构架,就像一张蜘蛛网,用户在其中搜索任何一个单一信息,都能牵引出与之相关的连带信息。比如,搜索特定突变基因可以查看其在不同的肿瘤模型(PDX/CDX/Syngeneic)和肿瘤类型中的关联性,从而帮助用户加强对该领域药物研发的验证。

简单、易懂、易用是这个平台的理念和突出特点。以往的肿瘤模型数据库,通常需要专业的肿瘤生物信息学家或肿瘤药理学家才能理解和操作,这在一定程度上限制了其他药物研发工作者的使用。药明康德作为一个开放性的创新平台,一直秉承着降低研发门槛的理念,使每一个人都能参与到药物研发的关键流程中来。

为此,我们凭借自身丰富的经验积累,站在一个创新药物研发科学家的角度,不仅仅是将所有数据整合在一起,还通过简单易用并且有引导性的操作界面降低用户使用门槛。我们相信,一个简单、易懂、易用的数据信息库能够使更多致力于癌症药物研发的有志之士,迅速找到所需的模型,缩短药物研发的周期,真正的惠及病患。就像好莱坞电影《良医妙药》主人公的原型,Amicus Therapeutics 生物技术公司CEO,John Crowley先生曾经通过我们药明康德的平台做到过的那样。

生物探索:OncoWuXi对药明康德以及全球癌症药物研发的发展将产生怎样的影响?

冀群升:秉承药明康德的主旨,始终坚持为客户提供开放式,一站式,一体化的整合型服务平台,OncoWuXi就是基于这个理念搭建的。OncoWuXi的诞生,将帮助药明康德完善其在精准癌症药物研发方向的布局,打造全球顶级癌症药物研发服务链的地位。

随着精准医疗理念的逐步落地,再加上大数据、云服务以及互联网思维的影响,现代药物研发对于数据/信息可查阅性的要求越来越高。我们相信OncoWuXi将对药物研发产业链新一轮的思维革命起到推动作用,助力癌症药物研发由以前“繁复冗长”的旧模式转变到“快,准,狠”的精准研发新模式。

生物探索:未来,药明康德希望将该OncoWuXi打造成怎样的平台?

冀群升:OncoWuXi还仅仅是一个开端。依托药明康德强大和全面的研发及支持能力,我们将对其进行实时的更新和不断的升级维护,给用户带来最佳的服务。同时,我们会持续创新,将更多的理念和功能整合进OncoWuXi,甚至包括与科学家的互动,都可以在这个平台上完成,真正做到“一站式,一体化”。未来,我们会将其推送到世界上任何一个需要的人手中,从而实现所有药明康德人的共同梦想:为任何人,任何公司提供实现新药研发梦想的创新平台。

关于冀群升博士



冀群升博士,药明康德肿瘤事业部负责人,副总裁

冀博士于第一军医大学获得医学学位,并在协和医科大学/美国Vanderbilt大学获得博士学位。他先后在阿斯利康,OSI和Onyx等业界著名企业供职15年,有着丰富的癌症药物研发和转化科学研究的领导经验。

来源:生物探索


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