IBM挖掘微生物测序价值

莺歌燕舞

2009年10月份，IBM宣布，将加入到降低个人基因组测序成本的竞争中，不仅有望将价格降低到1000美元以下，最终甚至有可能降至100美元的水平。

早在2010年1月份，IBM Thomas J. Watson实验室(Yorktown Heights, NY, USA)的计算生物中心高级经理Ajay Royyuru就对外宣传过”生物学越来越成为一种信息学科学，对于IBM而言更是一种业务”，而后者正是IBM的专长所在，因此IBM计划设计发明出更快更便宜的测序技术。

也就是在当年的7月份左右，罗氏和IBM公司宣布将共同开发基于纳米孔的测序技术，拟采用IBM研发部门开发的DNA Transistor技术来快速高效地对人类DNA进行直接读取和测序。当DNA分子穿过硅芯片上纳米大小的孔时，该技术能破译DNA分子，从而实现真正的单分子测序。根据罗氏和IBM当时的说法，与其它现有测序技术或正在开发的技术相比，这项技术在费用、通量、规模和速度上都具有“重大优势”。

然而在2013年，罗氏却宣布因涉及的技术风险较高，结束了与IBM合作开发纳米孔测序平台的伙伴关系。

2013年4月9日 IBM和CLC生物信息公司将结合二者的硬件和软件产品，联合为客户提供一个高通量测序数据分析的一条龙服务平台。平台有3种不同的配置，从48个CPU和192GB内存到192个CPU和768GB内存，取决于客户的要求。

在今年的3月19日，IBM表示他们将利用其超级计算机“沃森”的云计算系统与位于纽约的基因组研究中心合作，帮助开发治疗脑胶质瘤的方案，以期战胜人类脑癌。

在4月份，各大外媒也纷纷报道IBM公司喜欢大数据，获取的越多，就越能向用户销售出更多的服务器、存储和服务，并将充分利用大数据变革医疗行业。

5月6日至7日，在IBM硅谷阿尔马登研究中心召开了“为城市测序：在大数据时代的宏基因组学”的专题研讨会。其中比较受业内人士关注的是来自全球领先的科技新闻网站CNET News中的一篇报道“IBM sees big opportunity in sequencing microbes”。文章中指出，IBM公司拟通过对生活环境（农场、地铁等）中的微生物进行测序，挖掘自然环境中大量有益微生物。

在地球这个生态系统中，存在着大量的微生物，尽管目前世界上已经建立了3000多种细菌的全基因组数据库，随着技术的开放，获取这些数据库也越来越便宜。

来源：生物探索