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专访华因康创始人盛司潼:打造保质保量的国产测序仪

2015-11-4 11:39| 编辑: 小桔灯网| 查看: 2533| 评论: 0|来源: 测序中国

摘要: 10月18日,华因康公司携863项目重要成果HYK-PSTAR-IIA,亮相第74届中国国际医疗器械博览会,并全面系统地展示了该款产品的核心专利、技术优势及临床应用等方面,分享和探讨了临床及科研领域的应用经验。大会结束后, ...
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10月18日,华因康公司携863项目重要成果HYK-PSTAR-IIA,亮相第74届中国国际医疗器械博览会,并全面系统地展示了该款产品的核心专利、技术优势及临床应用等方面,分享和探讨了临床及科研领域的应用经验。大会结束后,华因康公司创始人盛司潼接受测序中国独家专访,详细介绍了这款国产测序仪。
测序中国:祝贺HYK-PSTAR-IIA测序仪成功发布,首先请您介绍一下这款测序仪的具体情况?
盛司潼:一般来说,二代测序仪的核心技术主要分两种:一是光学检测技术,二是离子流检测技术。HYK-PSTAR-IIA测序仪采用了光学检测技术,其中核心的生化反应以及相关试剂等方面都拥有自主知识产权。由于使用范围有区别,各大测序平台都有不同的侧重点:有的平台读长较长;有的平台精确度会更高。在打造HYK-PSTAR-IIA测序仪的时候,我们将其定位为临床使用,因此更重视测序周期和精确度。基于我们的核心专利技术,从样本制备、测序到出具报告,整轮检测时间可缩短至10小时,精确度达到99.9%,一次运行的通量为7千万条reads。另外我们设计了多种规格的反应模块和分区设置,在一块胶膜上可以同时进行不同的检测。单次测序样本的数量也可以灵活调节从4-1000个不等,这样就能够有效降低单次测序的成本,在实际临床应用中更经济。

我们现在谈到的测序仪,不仅仅是一台仪器更应该是一整套平台。除了在某一项技术上有过人之处,其相应的配套技术上也需要有所发展。我个人看来这也是整个测序技术在国内这么多年发展过程中比较困难的地方。测序平台本身是一个非常复杂的系统,从样本的提取、保存、制库,到上机测序、数据计算、质量分析,再到出具结果报告,其中涉及化学、生物、生物信息学、医学、统计学等多学科知识。因此一个测序平台比大家了解到的更为复杂。

因此,我们整合了测序实验步骤,将它们放在一个平台里来完成,就是希望简化操作步骤,方便客户的使用。另外,降低从上游到下游的成本叠加。也便于我们对测序平台进行优化,可以从整体上控制成本。

测序中国:华因康从当初着手研发测序仪到现在,这期间做了哪些关键步骤的优化?
盛司潼:十几年前,PCR也是比较难操作的,变性、退火、延伸等步骤加上几十的循环使得当初的推广也不容易。但是随着仪器不断的优化,操作更为简单,大家的实验室里也都备有PCR仪了。正因如此,我们优化操作的每一个步骤。

我们的科研测序平台在08年就已经研发完成,接着我们花了几年的时间来进行平台优化改良,让它更适用于临床。针对不同的样本,定制不同的提取试剂。以前需要6、7步完成的实验反应,现在1步搞定。包括对测序结果的分析也是如此,我们将繁琐的分析步骤放在后台,在后台完成信号处理、碱基识别、质量控制、SNP分析等繁琐的步骤。而大家从软件页面上看到的是清晰的图形界面,也更符合大家的使用习惯。

测序中国:目前,大多医生们是“读不懂”基因测序报告的,针对这个问题你们是如何考虑的?
盛司潼:确实如此,考虑到成本的问题,大多数医疗机构都很难配有专业的生物信息分析人员以及解读人员,去专门解读测序报告,搜索突变关联的疾病,以报告给临床医生。

而我们在出具报告前会调查大量已有文献,将已报道的突变基因罗列出来,并将搜集与该基因相关联的疾病。在报告上就会告诉医生,某种突变代表的意义是什么?关联的疾病有哪些?这样医生们就能读懂报告了。

优化整个测序平台,简化操作,就是为了给使用者提供最大程度的便利。

测序中国:接下来,在新产品生产以及市场推广方面,公司有哪些打算?对于新测序仪的市场有何预期?
盛司潼:对于我们来说,现在想做的主要有两点:一方面是让平台能够进入更多的应用机构,让使用者们了解新平台的优势。虽然新平台定位在临床方面使用,但也能用于科研,为医疗人员带来科研价值。另一方面,新测序仪已经获得CFDA的医疗器械批准,我们现在也已开始进行批量生产。这一点上我们希望做的更好,做到保质保量。

现在还是测序仪推广的早期阶段,基因数据要通过不断的应用来得到。今天,我们能测得一些数据,未来还有新的东西出现。通过科学研究的积累,以及新技术的开发,人类未知的领域会逐渐地浮出水面,不同病种要检测的指标也会越来越清晰。因此我们还是希望采取合作的方式,跟各种机构一起来探索、开发新应用。

测序中国:18日上午,华因康的试剂研发生产华中基地落户武汉光谷,是否意味着公司有新的计划?
      盛司潼:由于在测序实验中需要的试剂品种会非常多,需求量也会很大。从公司发展的角度考虑,武汉有优质的高校资源、技术人才资源,于是决定在武汉光谷建设试剂研发基地,也就是公司未来的试剂生产基地。基地建设完成后,将按照市场的需求规模生产。另外,从试剂的运输角度考虑,我们希望在不同省市设立能够快速供应试剂盒的销售渠道。后续也会在不同地区建立新的研发基地。
 


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