今天我们了解一个检测灵敏度低的mRNA检测技术SCOPE,该技术同时采用基于Cas13a旁切信号放大和T7转录的2种信号放大方法的联合策略,显著提高了检测灵敏度。 SCOPE技术的具体原理如图1所示,首先就是先利用集合靶标RNA序列后的Cas13a的旁切活性来释放和放大荧光信号,其次就是旁切后的T7转录活性被释放从而转录产生更多的靶标RNA片段,从而开始进一步放大信号,实现荧光信号强度的二次放大,而且整个过程也只需要不到1个小时,真的是又快又准。 图1引自[1] 和之前仅仅基于Cas13a的旁切活性放大信号的单一方式相比,SCOPE技术的旁切加转录来二次放大荧光信号的检测灵敏度更高,信号强度也更大(图2)。 图2引自[1] SCOPE的二级信号放大策略非常优秀,另外采用High FIdelity的Cas13a突变体也可以帮助有效的实现点突变级别的RNA检测,帮助降低假阳性,是一种非常好的RNA检测技术。 参考文献: 1. Song, J., Cho, M.H., Cho, H., Song, Y., Lee, S.W., Nam, H.C., Yoon, T.H., Shin, J.C., Hong, J.S., Kim, Y. and Ekanayake, E., 2024. Amplifying mutational profiling of extracellular vesicle mRNA with SCOPE. Nature Biotechnology, pp.1-11. |