一代测序丨上机前加HiDi的作用

昨天“基因测序那些事”群内有个伙伴提出了一个关于一代测序技术的问题：一代测序上机前加入HiDi的作用是什么？

多位老师迅速给出了解答，写篇文章认真记录下这些宝贵的知识点。

老师1：用于悬浮纯化的核酸。并附上文件：cms_086588.pdf

老师2：去离子甲酰胺作为缓冲液中的离子化溶剂，被广泛应用于生物化学和分子生物学，特别是核酸研究。长链DNA或RNA在98%的甲酰胺中可以完全变性（常温条件下），而且在这种条件下不影响碱基组成和二级结构，可以得到完好的DNA或 RNA单链。在DNA 测序和聚丙烯酰胺凝胶测序中使用甲酰胺可以有助于消除核酸中的二级结构，从而克服测序产品二级结构迁移和压缩的问题。

老师3：那就是彻底舒展开DNA，能够完全按照长度来跑毛细管。

此外，我问了下智谱清言：一代测序上机前加HiDi的作用是什么？

它的回答如下：在测序流程中，于上机前加入HiDi（高离子强度变性剂）的举措，其主要功效在于提升DNA样本的浓度，并促进DNA分子在测序过程中的有效分离与延伸。这一步骤对于增强测序信号的清晰度和精确度起到了至关重要的作用。HiDi的应用，不仅有助于防止DNA分子在测序时发生缠绕或聚集，从而降低测序错误率，提高测序的整体质量，同时也助力于清除样本中的杂质，确保测序反应的高度纯净。