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啊,单细胞测序平台还有鄙视链?

2024-6-25 15:19| 编辑: 归去来兮| 查看: 7884| 评论: 0|来源: 循因缉药

摘要: 本文提到的技术举例只是随手举例,并不代表其他家做的不好。

作者:星海领航员

今天,在我们单细胞群里看到一张来自小红署上的图。
大家先看下,然后欢迎在评论区留言。
接下来,我来说说自己的一些观察。

(由于平台规则必须挡住那几个字,并非刻意遮挡)
想跟大家聊3个点:
单细胞测序平台鄙视链有道理么?
国产单细胞平台这两年做的怎么样?
国产单细胞平台最近又在做些什么?
先声明下,本文提到的技术举例只是随手举例,并不代表其他家做的不好。

有理?


这显然是不对的。
10x Genomics作为龙头,那当然是大家都认可,毕竟是开创了一个新赛道。
然而,他就是无敌的么?
不一定啊。

从技术路径上来讲,10x Genomics用的微液滴法进行的单细胞分选。
出来的液滴大小相对固定,遇到一些长的不那么“标准”的细胞就会有问题,这也给了微孔板法的一些解决方案机会。

这里面比如新格元GEXSCOPE、寻因的SeekOne MM平台等,都是通过微孔板法来进行单细胞编码,也能够兼容形状特殊的细胞。
另外,各家还有各种有特色的技术。

比如M20 Genomics使用的随机引物扩增配合微孔板法,既可以做全长转录组,又可以解决无poly(A)尾RNA的物种RNA捕获问题。
都不在一个维度上pk,鄙视个毛线...
科学研究这东西不是说你买个最好的试剂、用最好的技术,就能堆出牛逼的文章。
先弄明白自己要做什么,然后再选择合适的工具,这才是科研思路。
求求了,别把鄙视链这个臭毛病带到单细胞圈了。

进步?


咨询了下几个代表性的国产单细胞平台的文章发表情况,以上为2022-2023年的文章数量汇总。
各家的统计口径各有不同,且不可能完全统计,有个大概的概念就行
是不是会有人杠这些文章影响因子不行啊,都是水货?
抱歉,让您失望了。

我随便选出来一些影响因子比较高的文章,其他没入选的并不代表没有哈,只是随手翻到的。
能不能发高分文章跟是否用国产单细胞测序平台这事没啥关系,就跟你用iPhone 15 Pro Max 5G 1TB暗夜紫跟你能不能上王者一样没啥关系。
另外,从文章数量的提升也可以看出来国产单细胞测序平台逐步受到了科研界的认可。
这,就是我们自主品牌进步的标志。

前几天,新格元还跟HCA达成了合作,这也是国产平台进步的标志之一。
不是说国产的东西不行么?非得老外认可?这次还有什么要说的么?

扩散?


随着单细胞测序领域的竞争加剧,国产单细胞平台的竞争也呈现扩散化、多元化趋势。
有的在忙着迭代产品。

代表性的就是MGI华大智造,还推出了新的TaiM 4自动化液滴生成仪,把DNBelab C系列试剂干到了V3.0。
有的在忙着扩充自己的产品线。

代表性的公司如寻因生物的SeekSpace空间转录组技术,成功杀入空间生物学赛道。

还有墨卓,悄悄推出了MobiNova S1单细胞分选系统,杀入药物研发领域。
有的在忙着出海。

华大智造自不必说,出海做的风生水起。
通过“What If”全球巡演,并依托其DCS Lab组学前沿实验室,全球布局,直接平推。

新格元在欧洲、美洲也都有布局。
比如admera就是他们美国的授权服务提供商,有意思的是,admera还是华大时空组学的授权服务提供商。
这就是中国自主品牌全球化扩散的力证之一。

当然,不是所有的公司都得马上冲出去布局设点,出海全球化也可以先从开通一个X(Twitter)账户开始。
(尚不确定是否为官方账号,仅做展示)

最后


竞争,就是一种优胜劣汰的过程。
当今世界,论竞争烈度,我国绝对排得上号。
身处其中,作为消费者,我们应该很开心能有这么多国内外厂商“伺候着”。
这种竞争的结果就是,既有新技术、新平台不断涌现,又有科研成本的不断下降。
仔细想想,是不是赚翻了?
最后,打个补丁。
如果要覆盖所有国产平台,这篇文章可能永远写不完。
引用的各项数据,可能不全面,排名也不分先后,望各位勿怪。
再次感谢提供数据的各个厂家。

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