PacBio以SMRT长读长测序技术而闻名,关于其发展历程、核心技术以及相关平台之前有介绍过:PacBio SMRT 测序技术及发展历程;一文了解PacBio文库构建流程;PacBio长片段核酸提取技术与流程;PacBio新款长读长测序仪Revio有哪些看点? 今时已不同往日,现在PacBio已经成为同时拥有长读长和短读长测序技术的唯一(在我印象中是)玩家。今天我们要聊的就是他们推出的第一款短读长测序仪—Onso。 这台仪器的推出一下子就引起了热议,原因是这位“卷王”宣称自己的测序仪准确度进入Q40时代。 以往NGS厂家都是以Q30来表征测序准确度,如illumina、MGI,现如今也在跟随潮流卷进Q40的时代。 2月6号,在2024年AGBT(Advances in Genome Biology and Technology,基因组生物学技术进展会)上,MGI发布全新一代测序试剂StandardMPS 2.0:准确度提高十倍!华大智造面向全球发布StandardMPS 2.0测序试剂,开启基因测序质量Q40时代。该产品能够使DNBSEQ平台测序数据的质量达到Q40(99.99%)>85%*,相较于Q30的准确度提升了十倍。 illumina在23年10月份就提到NovaSeq可通过软件升级实现80%的碱基达到Q40准确度,更多的这方面的举措暂时还没查到。 优点:数据质量高 首先是测序质量,不论是PE100还是PE150都可以做到90%以上的碱基质量大于Q40,远高于MGI和ILLUMINA。 缺点:单独设备加载且时间长 在小编印象里,华大智造的DNBSEQ-T7也需要配备单独的加载设备,此平台是由于芯片面积大通过常规方式加载样本均匀分布较困难,因此在加载时设计了复杂的液路体系,这个过程需要2h,一次可同时加载两张载片。但华大智造的中低通量测序仪如MGISEQ-200,DNBSEQ-G99等不需要单独的加载设备。 上图就是Onso加载的设备,需和测序仪配套使用。根据他们的操作指导所述,加载时间需要超过5h,并且不包括前期的准备!这个时间应该没有算在测序时间里面。以下是加载详细的流程。 以上是对Onso测序仪的介绍,总的来看,Onso的绝杀是在测序质量上,目标领域客户是在肿瘤低频突变等对数据质量高的应用上。 下一期我们将继续聚焦Onso测序仪,介绍其测序原理、建库流程等方面的内容,欢迎大家持续关注! 这是春节前最后一篇推文,预祝大家新春快乐,龙年大吉。 |