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分子诊断必修课,PCR核心Taq酶的前世今生和修饰改造!

2023-7-24 13:47| 编辑: mango524| 查看: 2447| 评论: 0|来源: IVD工具人

摘要: PCR技术改变了现代分子生物学,而Taq DNA聚合酶改变了PCR。


PART 1
Taq酶的前世今生

PCR技术改变了现代分子生物学,而Taq DNA聚合酶改变了PCR。

Taq DNA聚合酶是PCR反应中最核心的酶, 最初用于PCR的DNA聚合酶是20世纪70年代初期由Klenow发现的来源于大肠杆菌 DNA聚合酶I上的 Klenow片段来生成新的子链,但是这种大肠杆菌酶对热敏感,易受到变性阶段高温的破坏,从而无法继续进行退火和延伸步骤。因此,需要在扩增全程每个循环的退火步骤中重新补充添加酶。

1976年,一种更稳定的Taq DNA聚合酶从一种叫做水生栖热菌(Thermus aquaticus的嗜热细菌中分离出来,这种细菌是从美国黄石国家森林公园的火山温泉中分离得到的,生长在70-75℃极富矿物质的高温环境中 因此,Taq DNA聚合酶具有极高的热稳定性,或许能够承受PCR的热变性步骤。

1988年,Saiki等将Taq DNA聚合酶用于体外PCR扩增,不但实现了PCR自动化,还因为提高了退火和延伸温度而提高了产物特异性。这个研究鼓励了更多的技术人员使用Taq DNA聚合酶进行PCR。

1989年,Lawyer等利用特异性探针从Taq DNA聚合酶基因文库中钓取了Taq DNA聚合酶全长基因,最终得到一个2499bp的编码序列,GC%高达68%,他们将该基因克隆到大肠杆菌中,通过诱导表达和分离纯化得到纯的Taq DNA聚合酶。

与大肠杆菌 DNA聚合酶相比, Taq DNA 聚合酶具有很高的热稳定性,在92.5℃、95℃和97.5℃时,其半衰期分别为130、40和5分钟,并且能够获得更长的PCR扩增子,具有更高的灵敏度、特异性和得率。

PART 2
Taq酶的功能特性
Taq DNA聚合酶的氨基酸顺序,特别是氨基酸的前1/3区域,与大肠杆菌聚合酶I非常相似,因而它们属于一种多功能酶,其主要酶学特点包括:
耐热性
5'-3'聚合活性
5'-3'外切核酸酶活性
部分PCR产物3’末端加A
无3'-5'校正活性
PART 3
Taq酶的工程改造
尽管 Taq DNA 聚合酶大大改善了PCR实验方法,但也表现出一些缺点。例如,Taq DNA 聚合酶在90℃以上的DNA链变性温度中相对不稳定。对于需要更高解离温度的富含GC或具有强二级结构的DNA模板而言,这一问题尤为明显。
针对Taq DNA聚合酶的缺点,后续做了一系列的改进优化,比如反应缓冲液的优化、加入热启动技术增强特异性、使用基因工程技术改造Taq DNA聚合酶等等,使得酶的稳定性、特异性、扩增能力等方面都得到了加强。
常用的Taq DNA聚合酶修饰方法主要有:抗体修饰、化学修饰和适配体修饰。
随着分子诊断技术不断革新,对PCR反应的速度、灵敏度、特异性和多重扩增能力也有了更高的要求,而优质的DNA Taq聚合酶则是满足这些要求的重要奠基石。

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