说到微生物组研究，肠道菌群检测，大家首先想到的就是扩增子测序，比如16S测序。16S测序因其高性价比，简单易懂的数据结果，成为上手微生物组研究的入门工具。 而研究微生物组的另一个工具——宏基因组测序，却常被大家忽视。究其原因，一方面可能是其价格略高（价格和价值是匹配的），另一方面是大家觉得做16S测序就挺好，像是没必要去做宏基因组测序。真的是这样吗？ 近期Cell上的微生物组文章再次强调使用高分辨率的宏基因组测序开展微生物组研究的必要性，因为其不仅有到种（species）水平的更高的物种分辨率，而且还能提供菌群的基因功能信息，这将有利于全面精细地解析菌群的物种组成，并基于菌群携带的基因信息来阐释菌群发挥的功能（Yap et al. Cell (2021)）。 因而宏基因组测序不仅能鉴定样本中细菌群落的物种组成，还能检测其他微生物群落的组成。也是因为宏基因组测序是对菌群的全部基因进行测序，使用信息量更丰富的基因数据库（如NR库）进行菌群的物种鉴定，使得其具有更高的物种分辨率，可以 |
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