5个关键词 | 华大智造2021测序仪业务线新品解读

    关键词1：V2.0   

对于短读平台而言，PE300或SE600可以说是各大机型的“读长天花板”。目前已经支持6种读长模式的MGISEQ-2000又一次完成“自我突破”—基于FCS小通量载片的PE300测序试剂盒，在读长方面实现了从PE200到PE300的飞跃。在此之前，市面在售能实现PE300或SE600的只有两个系列的机型：一个是illumina的MiSeq系列，另一个是Thermo Fisher的Ion GeneStudio S5系列，如今华大智造MGISEQ-2000终于跻身此列。

表2 具备PE300/SE600读长能力的三款机型一览

MLG，一种全新的DNA纳米球的制备与加载技术，是Make DNB、Load DNB、Grow DNB这三个动作的首字母缩写，也正是此次华大智造2000平台突破PE300的关键所在。这一技术的核心是“DNB两步养成计划”。

尤其是横跨多个位点的DNB（Split DNB）可能会被软件错误地识别为多条Read，从而形成 Optical Duplicate Reads。在进行DNB加载时，DNB大小均一性越差以上情况会越发严重，进而直接影响到碱基信号的识别，降低本轮测序实验有效数据的产出和数据质量。而且，测序载片密度越高（例如，每个位点之间的间距从900nm缩减到715nm），对DNB大小均一性的要求也会相应增高。

为了提高DNB均一性，进一步提高有效数据产出和测序质量，通常可以通过缩短DNB生长时间（即滚环扩增时间）来实现。但是缩短DNB生长时间又将带来新的问题—DNB拷贝数减少，不能满足后续测序要求怎么办？

如何做到提高DNB大小均一性的同时又保证DNB拥有满足测序要求的足量拷贝数呢？MLG技术可以！MLG技术基本流程如下图所示：

图1 DNBSEQ核心技术及其优化后的MLG技术对比

第一步，DNB生成：通过缩短滚环扩增时间获得一批“小个头”的DNB（比如，先只复制扩增100个拷贝数），以此提高DNB的均一性。

第二步，DNB加载与二次生长：等这些“小个头”DNB在载片位点上“占好位置”，再加入相应的生化反应试剂将其激活，让它们在载片位点上继续滚环扩增、继续生长（即Grow DNB），直至长到后续测序实验所需的大小（例如支撑PE300测序，则可进一步增加DNB拷贝数）。

目前MLG技术不仅被用于MGISEQ-2000 PE300试剂盒的开发，也同样应用到了T7 平台的V2.0 PE150试剂盒，进一步提高了T7平台单载片的有效数据产出（5000M+）。

图2 BBS与常规测序的“测序时间分辨率”对比图

ATOPlex是华大智造的多重PCR定制平台，也是今年正式发布的建库试剂盒定制化业务的代名词。基于该技术的新冠Panel在疫情期间支援全球，国内“客定版”Panel也订单不断，在本次发布会上该产品也终于正式外对。该产品具体信息大家可参考华大智造官方介绍材料。

截止到目前，今年还未有新的测序机型完成商业化，其实关于机型更新迭代，市面上一直有两种声音：迭代太快和迭代还不够快。关于这个行业的机型更新与迭代，你怎么看？欢迎大家参与讨论。

说明：本文为读者投稿，文章作者为利益相关方。