新冠变异株至2020年底发现以来，目前已超千种。可能你听过501.V1，可能又听过B.1.1.7，或者又听过Alpha，这些名字都是不同的变异株吗？答案却是否。 下图就是对重要突变株不同平台或时期的名称。
明确变异株确切的名字后，还需要知道变异株的重要度。目前，根据传染力、致病率等因素，WHO公布最受关注的Alpha，Beta，Gamma和Delta变异株。并且目前Delta变异株占比最高。
新冠变异可以出现在序列的每一个位置，包含ORF1a、ORF1b、S、ORF3a、E、M、ORF6、ORF7a、ORF7b、ORF8、ORF9b、N区域，每一个区域都已出现了碱基的突变。
如果就核酸检测新冠突变，我们优选S基因区域。 因为新型冠状病毒的刺突蛋白（Spike蛋白、S蛋白）是病毒进入细胞和介导细胞融合的一个重要的病毒结构蛋白。病毒通过S蛋白上受体结合域（receptor binding domain，RBD）与宿主细胞的受体结合。进而病毒与宿主细胞融合。 S蛋白意义重大： S蛋白与病毒的传染能力及发病机制等密切相关。 S蛋白是宿主中和抗体的重要作用位点。 S蛋白可通过RBD的基因重组或突变可以实现不同宿主间传播，并导至较高致死率。 S蛋白是疫苗设计的关键靶点。 新冠变异位点那么多， 我们具体应该如何选择呢？ 选择的原则有： 1. 检测位点有明确意义，如增强传染力，提高致死率，增强免疫逃离能力等 2. 高度关注的变异株特有的突变位点 3. 能够尽可能多的覆盖VOC和VOI 根据原则，我们选择的方法有很多种，有的厂家选择一个突变位点一个试剂盒的方式，有的厂家选择一个变异株几个位点一个试剂盒的方式，也有的厂家组合不同位点为一个试剂盒的方式。 这里推荐两种选择方式 第一种，最优的方式是将每个变异株重要的突变位点都选择检测，但是这种方式最花时间与成本。
第二种，我们选择重点关注的突变位点，如最重要的E484K，其次是L452R、K417N、P681H等下图中描黄的突变位点。综合这些位点，我们就能推断出大多数受关注的变异株了。
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