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解读丨NGS建库DNA分选纯化磁珠技术的优势,同样品质,3倍成本之差,你选谁?

2020-3-21| 编辑: 班木芙兰| 查看: 3495| 评论: 0|来源: 小桔灯网

摘要: 高通量测序技术(NGS)日趋成熟,应用广泛,但在整个过程中所使用的仪器、耗材和试剂,仍然还是由国外垄断,这对于已经占据全球测序10%产业规模,且在增长黄金期的中国企业来说并非长久之计。尤其是随着欧美贸易保护 ...


高通量测序技术(NGS)日趋成熟,应用广泛,但在整个过程中所使用的仪器、耗材和试剂,仍然还是由国外垄断,这对于已经占据全球测序10%产业规模,且在增长黄金期的中国企业来说并非长久之计。尤其是随着欧美贸易保护、地缘政治以及“再工业化”的升温,严重依赖进口不仅导至我们在整个产业结构中没有议价权,同时还面临着随时被“卡脖子”的风险。
而今天需要和大家讨论的是在NGS中,一个极其重要的试剂——分选/纯化磁珠
众所周知,样本测序前需进行文库制备,制备过程中,使用磁珠进行纯化分选,使文库大小符合测序仪读长,以更高效地进行测序。目前在市面上的分选/纯化磁珠产品中,国外企业仍占据着该领域的绝大部市场份额,仅美国一家公司所生产的XP磁珠便占据着磁珠品类总销售额的半壁江山。尽管国内多家企业在跟进该磁珠市场,但由于起步晚、品牌弱等问题,一直存在着比较明显的发展阻力。但随着近年来我国对自主品牌扶持力度的加大,以及企业研发投入的持续增加,目前该领域市场正发生着微妙的变化。
成立于2009年的翊圣生物就是其中的磁珠生产厂家之一。据悉,翊圣生物是一家长期专注于分子酶原料及建库试剂盒等产品的研发和生产的生物技术公司。该公司相关负责人表示:通过技术与规模化改变上游被垄断的现状,为下游企业提供更高性价比的产品,节省更多的成本,推动NGS技术更早成为大众都用得起的技术,正是翊圣生物作为一家上游企业的使命。

磁珠是翊圣生物在2015年的业务布局,成立了专门的以中科院博士带头的NGS研发团队,经历了3年多的时间,开展了大量的研发、量产以及严苛的测试工作,直到产品品质达到与进口XP磁珠技术水平高度一致(见下图),才于2018年正式上市。下面,就让我们详细了解一下翊圣生物磁珠的具体技术参数。



图1. 翊圣磁珠与进口XP磁珠在不同比例下回收效率对比,来源:翊圣生物。注:DNA Marker中含loading等物质,影响核酸定量,因而初始的Input定量结果偏低,所以表中出现回收效率高于100% 

2. 翊圣磁珠与进口XP磁珠在分选效果上高度一致
相同小牛胸腺基因组DNA,分别使用翊圣磁珠与进口XP磁珠,在不同分选比列条件下, 片段大小与回收产量高度一致。

图2:小牛胸腺DNA选用不同比列磁珠分选2100图,来源:翊圣生物

3. 翊圣磁珠与进口XP磁珠在稳定性上高度一致
选择翊圣不同批次的磁珠,分别验证其在纯化和分选与进口XP磁珠的差异,证实翊圣磁珠的稳定性。
表:磁珠稳定性比较

来源:翊圣生物

常规构建一个DNA/RNA文库每次使用约200μL磁珠,使用进口XP磁珠,构建该文库的成本在10元/库,翊圣的价格最低可以做到3元/库,达到3倍之差!体现了国产试剂在性价比方面拥有的绝对优势

表:2020翊圣磁珠价格

来源:翊圣生物



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