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疫情之下，质谱可否有所作为？

2020-2-11 19:20| 编辑: 面气灵| 查看: 2254| 评论: 0|来源: 临床质谱网

摘要: 截至2月11日14时，全国确诊42718例，疑似21675例。此次疫情，中国所有省份无一置身事外。全国人民众志成城，共同参与到了防控疫情的战斗中。数据来源：丁香园国家在疫情扩散之前就派出了专家组前往武汉，虽说在春节 ...

截至2月11日14时，全国确诊42718例，疑似21675例。此次疫情，中国所有省份无一置身事外。全国人民众志成城，共同参与到了防控疫情的战斗中。

数据来源：丁香园

国家在疫情扩散之前就派出了专家组前往武汉，虽说在春节假期之前对武汉颁布了封城令，还是没有完全阻止疫情的蔓延。但是国家对病毒的鉴定速度，以及针对疫情的措施得到了大部分国家的专家和组织的支持和认可。

国家卫健委、疾病预防控制局也针对新型冠状病毒发布了防护指南和诊疗方案。其中，新型冠状病毒的诊疗方案已经出到了第五版。根据方案中“确诊病例”中明确规定：

临床诊断病例或疑似病例，具备以下病原学证据之一者:

1.呼吸道标本或血液标本实时荧光RTPC检测新型冠状病毒核酸阳性。

2.呼吸道标本或血液标本病毒基因测序，与已知的新型冠状病毒高度同源。

来源：新型冠状病毒肺炎诊疗方案

（试行第五版修正版）

那么除了官方方案中的两种检测手段外，质谱仪器能否进行新型冠状病毒的检测呢？其实，通过近来质谱厂商的一些声明可以看出部分厂家已经开始行动了。

来源：融智生物

来源：岛津

为了搞清楚MALDI-TOF在新型冠状病毒检测中的优势，编者也查阅了一些资料，但是编者在介绍MALDI-TOF之前，先简单讨论下目前的主流方法实时荧光RT-PCR方法，这样有助大家更好的比较和理解。不过小编不才，了解实时荧光RT-PCR方法的知识有限，所以引用一下行业大咖的评价和观点来阐述：

2月10日，中华医学会检验医学分会主任委员王成彬针对近期有媒体及专家反映新型冠状病毒核酸检测阳性率低等问题发布了一篇名为《关于新型冠状病毒核酸检测阳性率低的一点看法》的文章来答疑解惑，编者读了这篇文章真的是受益良多，收获了大量的知识。

文章第二段，王成彬主任对实时荧光RT-PCR方法发表了绝对的肯定。王成彬主任写到：“目前，无论是临床实验室还是疾病控制中心（CDC）实验室，普遍应用的是实时荧光RT-PCR方法，此检测方法成熟可靠，并已在常规检验和科研实验中被广泛应用。”王成彬主任随后提到这个检测方法的主要问题为前处理以及数据处理的时间过长。

其次，方便和之后的MALDI-TOF做对比，编者发现还有两个文中提到的问题也需要关注下：①患者体内病毒含量过少，可能导至现有方法检测不到；②扩增试剂中靶标基因位点的不同，以及试剂中有效成分的差异可能会影响最后检测结果的灵敏度。

所以，通篇来看，虽说有一些问题，但是实时荧光RT-PCR方法还是能很好的满足当前的检测需求的。那么，接下来我们聊聊质谱：

首先，编者好奇的是目前质谱针对病毒检测都做过哪些项目？于是，编者上网查了一下，发现国内的应用不是特别多，国外的相对多一些。

但是其中国内的一篇题为《基于多重PCR-质谱的冠状病毒高通量检测方法的建立与应用》的文章引起了我极大的兴趣，该文章是一篇以中国医学科学院、北京协和医学院为名义，发表于2018年的硕士生学位论文。

该论文开发了一种基于多重PCR与基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）联用的冠状病毒高通量检测方法（mCoV-MS），能准确监测已知的6种人冠状病毒（HCoV-229E、HCoV－OC43、SARS-CoV、HCoV－NL63、HCoV－HKU1和MERS-CoV），还能为发现新型人冠状病毒提供线索。我们都知道，SARS和MERS是高传染性，让人谈虎色变的病毒，而且这次的新型冠状病毒和SARS病毒在基因序列上还是有很大的相似性的，最重要的是，该篇论文中，多重PCR基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法与主流的实时定量PCR检测法进行了对比，所以这篇文章参考意义比较大。

该文的内容编者就不赘述了，感兴趣的老师和专家们可自行研究。那么该篇文章得到什么结论呢？

1.可以多位点同时检测。

多位点检测这是质谱的一大优势，有人认为检测一种病毒没必要多位点检测，但是病毒是时时刻刻都可能会发生变异的，位点过少病毒一旦发生变异就会出现假阴性的问题。而实时PCR荧光检测通常位点少，这也是王成彬主任提到的有厂家检测位点过少，位点过多后试剂效果和稳定性不好保障的问题。

2.方法的灵敏度更高。

高的灵敏度，即使病人体内病毒含量低，也可以很好的检测到。这样就无需连续检测，提高效率。王成彬教授提到患者体内病毒含量过少，可能导至实时PCR荧光方法检测不到。

3.多重检测，可以很快的为患者所感染的病毒定性。

当然，这个针对目前单个病毒的检测优势不大。

4.样本和样本之间、病毒和病毒之间没有出现交叉感染的现象，特异性强。

5.方法检测效率高。

该文章作者明确提到，使用单孔反应进行检测，一位工作人员能够在8h完成对超过760份样本的分析。目前实时荧光法的数据还不清楚，所以编者不好比较，还望专家指点。

当然了，目前质谱针对病毒的检测国内还处于初步阶段，肯定会遇到很多问题，比如自动化普及程度低、入门门槛高等等，这些还需要相应的厂家和机构的努力。

昨天，编者看到仪器信息网发布一篇名为《杭州市疾病预防控制中心因疫情紧急采购近5000万仪器设备》的文章，其采购内容引起了我的兴趣。

其中，排在第一位的就是全自动快速微生物质谱检测系统。这个不正是搭配MALDI-TOF MS的全自动系统吗？希望质谱在国难面前也能展露锋芒，做出贡献。

最后，文章有分析不到的地方，希望专家学者们能留言讨论，交流学习。

引用：

1、修乐山. 基于多重PCR-质谱的冠状病毒高通量检测方法的建立与应用[D]. 2018.

2、王成彬.关于新型冠状病毒核酸检测阳性率低的一点看法。

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