易感基因丨你的DNA不是你的命运，也不是你健康的良好预测者！

2019-12-30 09:53| 编辑: 面气灵| 查看: 13434| 评论: 0|来源: 基因talks

摘要: 根据阿尔伯塔大学（University of Alberta）最新研究，在大多数情况下，你的基因与患某种疾病风险的关系不到5%，基因并不能很好地预测大多数疾病的风险。研究者认为测量代谢物、化合物、蛋白质或微生物群可以更准确 ...

根据阿尔伯塔大学（University of Alberta）最新研究，在大多数情况下，你的基因与患某种疾病风险的关系不到 5%，基因并不能很好地预测大多数疾病的风险。研究者认为测量代谢物、化合物、蛋白质或微生物群可以更准确地测量人类的疾病风险，也更有助于诊断。这一发现与许多现代基因检测商业模式背道而驰（易感基因），后者认为基因检测可以准确预测一个人的患病风险。^1,2

迄今为止，已刊登发表了 3700 多篇全基因组关联分析（GWAS）研究，这些研究着眼于基因单核苷酸多态性（SNPs）对人类疾病或人类表型的遗传贡献。通过这些研究，许多非常重要的 SNPs 可以用来识别鉴定数百种疾病或医疗条件。然而，GWAS识别的 SNPs 或 SNPs生物标志物的组合在多大程度上可以预测疾病的风险还不是很清楚。

GWAS在疾病相关或疾病风险标记的报告方法上与大多数其他组学或临床/流行病学研究不同。很少有GWAS研究将多个SNP结合在一起，形成一个多标记的风险预测因子。因此，很少有GWAS研究报道与特定SNP或SNPs组合相关疾病风险或特征预测的敏感性、特异性、ROC曲线或ROC曲线下面积。

虽然GWAS研究的价值是无可争议的，但人们仍然担心单核苷酸多态性（SNPs）无法像最初希望的那样解释那么多的遗传变异（缺失遗传问题，missing heritability），^3,4也无法像预期的那样解释那么多的疾病风险。⁴

在迄今为止规模最大的荟萃分析中，科学家们研究分析了二十年来常见基因突变位点（也称为单核苷酸多态性，SNPs）与不同疾病和条件之间关系的数据。研究结果表明，大多数人类疾病和基因之间的关系是不可靠的。¹

阿尔伯塔大学（University of Alberta）生物科学系和计算科学系教授、该研究的合著者 David Scott Wishart 说道：“简单地说，DNA不是你的命运，SNPs 在疾病预测方面是有限的，甚至是不可靠的。绝大多数疾病，包括许多癌症，糖尿病和阿尔茨海默病（早老性痴呆），在遗传上的贡献率最多为 5％~10％。”

当然，也有一些例外，该研究还强调了一些值得注意的疾病，包括克罗恩病、乳糜泻和黄斑变性，基因在这些疾病的遗传贡献率约为 40%~50%。尽管这些疾病比较例外，但越来越清楚的是，大多数疾病的风险来自于你的新陈代谢，生存环境，生活方式或你接触到的各种营养物质、化学物质、细菌或病毒等。

研究者们发现非遗传因素通常比遗传因素更能预测疾病。特别是在GWAS（遗传标记）衍生AUROCs（ROC曲线下面积）和非GWAS（临床/蛋白组/代谢组）衍生AUROCs可以比较的情况下，研究者们发现典型的非GWAS研究（临床/蛋白组/代谢组）报告AUROCs接近0.81，明显高于基于遗传标记GWAS衍生的生物标志物0.64。（ROC曲线下的面积，值越大表示效果越好）

▲ 常见疾病的典型代谢、临床、蛋白组学和遗传标记的比较

研究者认为测量代谢物、化合物、蛋白质或微生物群可以更准确地测量人类的疾病风险，也更有助于诊断。这一发现与许多现代基因检测商业模式背道而驰（易感基因），后者认为基因检测可以准确预测一个人的患病风险。

最重要的是，如果你想准确地衡量你的健康状况，你的疾病倾向，或对疾病的应对措施，那么最好是测量你的代谢物、微生物或蛋白质，而不是你的基因。这项研究还强调了了解我们的环境，包括我们的食物、空气和水的安全或质量的必要性。

▲研究人员David Scott Wishart说，这项研究强调了了解环境因素如食物、水和空气质量如何导至疾病的重要性。（照片：John Ulan）

参考资料：

1.Patron Jonas,Serra-Cayuela Arnau,Han Beomsoo et al. Assessing the performance of genome-wide association studies for predicting disease risk.[J] .PLoS ONE, 2019, 14: e0220215.

2.https://www.folio.ca/dna-is-not-your-destiny-genetics-a-poor-predictor-of-risk-for-most-diseases-study-suggests/

3.Sandoval-Motta Santiago,Aldana Maximino,Martínez-Romero Esperanza et al. The Human Microbiome and the Missing Heritability Problem.[J] .Front Genet, 2017, 8: 80.

4.Visscher Peter M,Brown Matthew A,McCarthy Mark I et al. Five years of GWAS discovery.[J] .Am. J. Hum. Genet., 2012, 90: 7-24.

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