CRISPR-Cas碱基编辑器技术可实现靶向核苷酸改变，并正在迅速用于研究和潜在的治疗。最广泛使用的碱基编辑用的是大鼠APOBEC1（rAPOBEC1）酶，该酶诱导DNA胞嘧啶（C）脱氨，该系统由连接的Cas蛋白+指导RNA（gRNA）+APOBEC1组成。但是对于该系统是否会对RNA进行编辑，一直不是很清楚。 2019年4月17日，美国麻省总医院J. Keith Joung团队在Nature在线发表题为“Transcriptome-wide off-target RNA editing induced by CRISPR-guided DNA base editors”的研究论文，该论文发现具有rAPOBEC1的CBE可以在人类细胞中引起广泛的转录组范围的RNA胞嘧啶脱氨基，诱导数万个C-尿嘧啶（U）编辑，频率范围为0.07％至100％，范围是38％-58％表达的基因。CBE诱导的RNA编辑在蛋白质编码序列和非蛋白质编码序列中发生，并产生错义，无义，剪接位点，5'UTR和3'UTR突变。另外，该研究设计了两种带有rAPOBEC1突变的CBE变体，这些变异显著降低了人类细胞中RNA编辑的数量（减少> 390倍和> 3800倍）。 最后，研究人员显示最近描述的腺嘌呤碱基编辑器（ABE）也可以诱导转录组范围的RNA编辑。这些结果对碱基编辑的研究和治疗用途具有重要意义，说明了通过减少RNA编辑活动改造变异变体的可行性，并建议需要在碱基编辑器中更全面地定义和表征脱氨酶的RNA脱靶效应。 iNature发现，由于该研究的发表，导至基因碱基领域的公司股票暴跌，截至写稿前，发现张锋等人的Editas Medicine公司的股票暴跌，最多跌去每股2美元，共损失9818万美元（折合人民币6.59亿）。
CRISPR-Cas碱基编辑器技术可实现靶向核苷酸改变，并正在迅速用于研究和潜在的治疗。最广泛使用的碱基编辑用的是大鼠APOBEC1（rAPOBEC1）酶，该酶诱导DNA胞嘧啶（C）脱氨，该系统由连接的Cas蛋白+指导RNA（gRNA）+APOBEC1组成。之前对胞嘧啶碱基编辑（CBE）特异性的研究已经确定了人类细胞中的脱靶DNA编辑。
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在这里，研究人员显示具有rAPOBEC1的CBE可以在人类细胞中引起广泛的转录组范围的RNA胞嘧啶脱氨基，诱导数万个C-尿嘧啶（U）编辑，频率范围为0.07％至100％，范围是38％-58％表达的基因。CBE诱导的RNA编辑在蛋白质编码序列和非蛋白质编码序列中发生，并产生错义，无义，剪接位点，5'UTR和3'UTR突变。
研究人员设计了两种带有rAPOBEC1突变的CBE变体，这些变异显著降低了人类细胞中RNA编辑的数量（减少> 390倍和> 3800倍）。这些变体还显示出更精确的靶向DNA编辑，并且在测试的大多数gRNA中，编辑效率与野生型CBE观察到的相当。最后，研究人员显示最近描述的腺嘌呤碱基编辑器（ABE）也可以诱导转录组范围的RNA编辑。
这些结果对碱基编辑的研究和治疗用途具有重要意义，说明了通过减少RNA编辑活动改造变异变体的可行性，并建议需要在碱基编辑器中更全面地定义和表征脱氨酶的RNA脱靶效应。
参考信息：
https://www.nature.com/articles/s41586-019-1161-z
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