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廖国春:NGS在传染病领域应用

2019-9-6| 编辑: 小桔灯网| 查看: 260| 评论: 0|来源: 生物探索

摘要: 2019年9月4日-6日,由BioBAY联合中国医疗器械行业协会共同举办的DeviceChina2019于苏州国际博览中心召开。本届高峰论坛以“匠心智造,创新突围”为主题,共设1个主会场、2个分会场及1个专场路演,持续关注中国医疗器 ...

2019年9月4日-6日,由BioBAY联合中国医疗器械行业协会共同举办的DeviceChina2019于苏州国际博览中心召开。本届高峰论坛以“匠心智造,创新突围”为主题,共设1个主会场、2个分会场及1个专场路演,持续关注中国医疗器械行业生态发展、行业政策的最新变化;同时就医疗器械政策趋势、企业临床痛点、医疗器械新材料新领域、医疗人工智能、体外诊断、医疗器械投融资并购上市等热点话题进行探讨。

在9月6日上午“体外诊断”分论坛上,IDbyDNA Inc.创始人、首席执行官廖国春博士发表了以《NGS在传染病领域应用》为主题的演讲


IDbyDNA Inc.创始人、首席执行官廖国春博士

以下为主题演讲概要:

廖国春:很高兴在这里和大家介绍一下NGS微生物感染领域的应用。每年有1700万人死于可预防的传/感染病,其实主要原因是一些感染没有被完全检测出来,因此也造成了数十亿美元的医疗资源浪费。

传统的感染检测方法除了培养以外,大多是由医生根据病人的症状结合其临床经验去预判存在哪类疾病的可能性,再去做检测。但这一检测方法便存在一个问题:从预判出发而做的感染测试会有很多潜在的感染可能性没有被检测出来。

因此,我们猜想能不能在一开始就检测病原微生物呢?通过测序患者样本中的所有遗传物质,把传染病诊断问题转换成一个计算问题。

在这里,我们可以看到二代测序在感染检测中的好处。在感染监测中,有些病原微生物是PCR不能发现而NGS可以发现的。虽然NGS可以发现病原所有的微生物,但其临床应用也存在局限性:快速的反应时间;同时分析检测RNA/DNA病毒、细菌、真菌样本质量变化大;复杂的实验流程;试剂中微生物核酸的污染;以及国内医生不可能看检验报告超过五分钟,所以我们需要给到医生一个表格去快速了解致病原因。

针对这些问题,我们也提出了自己的解决方案:搭建了一个一站式平台,从原始病人病历开始把所有的程序都标准化。目前我们这个平台可以检测几乎超过五万个微生物,所有已知的微生物都可以检测,并且可以同时检测超过50,000种微生物;解释、平衡、验证以及优先化参考微生物DNA序列;发现和检测不常见的微生物(“宏数据库”)。

其实NGS的价格在大家的印象中还是比较昂贵,如何通过NGS的常规检查可以更精准的得出检测结果是需要考量的;让大部分患者负担得起,也是需要考虑的问题。我们现在已开始和领域里的仪器供应商合作,相信不久的将来,这项技术广泛应用于临床不是问题。

备注:以上演讲摘要,根据现场实录整理,未经嘉宾审核。

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